[发明专利]用于在复杂生物学或环境样品中鉴定化合物的方法和系统在审

专利信息
申请号: 202180010505.4 申请日: 2021-01-19
公开(公告)号: CN115004307A 公开(公告)日: 2022-09-02
发明(设计)人: 罗杰·吉内贝托梅乌;O·扬尼斯特拉多;J·卡佩拉德斯托姆斯 申请(专利权)人: 生物医学网络研究财团中心;佩雷-威尔吉利健康研究所基金会;罗维拉-威尔吉利大学;罗杰·吉内贝托梅乌
主分类号: G16C20/20 分类号: G16C20/20;H01J49/00;G01N30/86
代理公司: 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 代理人: 徐达
地址: 西班牙*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 复杂 生物学 环境 样品 鉴定 化合物 方法 系统
【权利要求书】:

1.用于在复杂生物学或环境样品中鉴定化合物的方法,特征在于其包括:

从施用至样品的与分离技术联用的质谱法分析接收(102)质谱(1),其中所述质谱(1)包含多个数据点(2),所述数据点具有保留时间(RT)、测量质荷比(m/z)和所测信号的强度信息;

查阅(104)分子式数据库(10),其包括多个分子式和电离加合物的分子离子的理论质荷比(m/z)T

对于质谱(1)的各数据点(2),在注释数据库(12)中注释(106)分子式和电离加合物的组合,其理论质荷比(m/z)T在考虑给定质量误差的情况下相应于所述数据点(2)的测量质荷比(m/z),其中各注释包括数据点(2)的保留时间(RT)和所测信号的强度;

对于注释数据库(12)中注释的各分子式和电离加合物,检测(108)在保留时间范围(RT0-RT1)中定义的关注区,其中所注释的数据点符合表征标准;

产生(110)包含列表(14),其包括所检测的关注区的保留时间范围(RT0-RT1)和与各关注区关联的分子式和电离加合物的理论质荷比(m/z)T;并且

将包含列表发送(112)至质谱仪用于通过串联质谱法鉴定样品中的化合物。

2.权利要求1的方法,其包括在质谱(1)中检测与所注释的分子式和/或电离加合物关联的同位素类似物,其中同位素类似物的检测包括:

在各关注区(28)的保留时间范围(RT0-RT1)中搜寻(162)质谱(1)的数据点(2),其测量质荷比(m/z)在考虑质量误差的情况下相应于与关注区(28)关联的分子式和/或电离加合物的同位素类似物的理论质荷比(m/z)T

获得(164)所发现的数据点的所测信号的强度;

起始自相应于分子式和/或电离加合物的关注区(28)的数据点的所测信号的强度,计算(166)所发现的数据点的理论强度;

将测量强度与计算理论强度比较(168);

基于所述比较确定(170)同位素类似物的检测。

3.前述权利要求中任一项的方法,其中关注区的检测(108)包括:

确定(122)在保留时间范围(RTC0-RTC1)中定义的候选区(20),其具有最少个数的数据点和/或最小密度的注释数据点;

表征(124)候选区(20),获得表征参数(22);并且

选择(128)表征参数(22)符合某些表征标准的那些候选区(20)作为关注区。

4.权利要求3的方法,其中候选区(20)的表征(124)包括从候选区(20)中的注释数据点(2)计算(132)线性回归(24)的斜率(m);

并且其中表征标准包括验证(142)计算斜率(m)的绝对值大于阈值斜率(mmin)。

5.权利要求3至4中任一项的方法,其中候选区(20)的表征(124)包括从候选区(20)中的注释数据点(2)计算(134,136)所测信号的平均强度(Iavg)和/或最大强度(Imax);

并且其中表征标准包括验证(144,146)计算的平均强度(Iavg)和/或最大强度(Imax)大于平均强度(IavgTH)和/或阈值最大强度(ImaxTH)。

6.权利要求3至5中任一项的方法,其中候选区(20)的表征(124)包括从候选区(20)中的注释数据点(2)计算(138)所测信号的强度范围,所述强度范围通过候选区(20)中最大强度与最小强度的比率定义;

并且其中所述表征标准包括验证(148)计算的强度范围大于阈值强度范围。

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