[发明专利]与大豆中疾病抗性相关联的新颖的遗传基因座

说明书

本发明涉及使用衍生自短绒野大豆PI441001、PI441008、PI446958、PI509501、PI583970、PI499939或PI483224的标记、基因和染色体区间来鉴定、选择和/或产生疾病抗性大豆植物或种质的方法和组合物。还提供了通过本发明的任何方法鉴定、选择和/或产生的大豆植物或种质。还提供了疾病抗性大豆种子、植物和种质。

关于序列表的电子提交的声明

以ASCII text格式、命名为81594-WO-REG-ORG_SEQ_ST25.txt并且大小5.1MB、于2021年1月21日生成的序列表与本申请一起提交。这个序列表特此通过引用以其披露内容并入本说明书中。

技术领域

本披露涉及用于鉴定、选择和产生增强的疾病和/或病原体抗性大豆植物的组合物和方法，以及新颖的植物。

背景技术

已知植物病原体对重要作物造成损害，这导致农业损失，伴随着对依赖植物材料的食物供应和其他工业的广泛的后果。同样，长期以来存在降低农业病原体对作物产生的发病率和/或影响的需要。

若干种病原体与对大豆的损害相关联，该损害在美国和全世界范围内单独地和共同地有可能造成重大的产量损失。示例性病原体包括但不限于真菌(例如，疫霉属和亚洲大豆锈病豆薯层锈菌)、线虫(例如，根结线虫属，特别是爪哇根结线虫)和大豆茎溃疡病。鉴于这些病原体存在对全球食物供应的显著威胁以及与处理大豆作物以预防产量损失相关联的时间和花费，需要用于产生病原体抗性大豆栽培品种的新方法。申请人期望可以引入商业大豆植物以控制大豆病原体的新颖的抗性基因(本文中，“R基因”)。

发明内容

通过简要概述，本披露尤其涉及新颖的大豆(Glycine max)植物，其基因组中具有选自SEQ ID NO:1、2、3或者其任何部分的染色体区间，其中与不包含该染色体区间的对照植物相比，该染色体区间赋予了增加的亚洲大豆锈病(ASR)抗性。本披露还涉及将病原体抗性传递到非抗性大豆种质或植物品系中的方法。另外，本披露主题提供了新颖的大豆品系，该品系在其基因组中包含衍生自短绒野大豆(Glycine tomentella)并且进一步在所述新颖的大豆品系中赋予亚洲大豆锈病(本文中，“ASR”)抗性的染色体区间、基因座和/或基因。还披露了选择包含该区间的植物的方法。下文更详细地描述各种实施例。

序列表的简要说明

SEQ ID NO:1-3是衍生自短绒野大豆品系登录PI499939的染色体区间，其分别在本文中称为“支架22052”、“支架50416”和“支架46213”。支架22052、50416和46213已被定位到位于短绒野大豆20号染色体的基因座。PI499939的遗传群体定位研究指示，短绒野大豆染色体20含有与ASR抗性高度相关联的染色体区间(例如，如对应于SEQ ID NO:1-3)。可以将这些染色体区间或其部分引入(即通过使用胚拯救和标记辅助繁育(MAB)或通过使用GM或GE引入渗入)到大豆品系中以创建大豆品系对各种疾病(如ASR)的抗性。表1-3表示SEQID NO 1-3中与ASR抗性相关联的单核苷酸多态性(SNP)。表1显示SEQ ID NO:1(支架22052)的SNP关联，并且表2显示SEQ ID NO:2(支架50416)的SNP关联。表3显示SEQ ID NO:3(支架46213)的SNP关联。确定了表1-3中鉴定的SNP的所有等位基因与针对ASR的抗性或易感性显著相关(p0.05)。

表1：在SEQ ID NO：1中与针对ASR的增加的抗性相关联的SNP位置

表1组织如下：(支架22052中的位置，有利等位基因，不利等位基因)

表2：在SEQ ID NP：2中与针对ASR的增加的抗性相关联的SNP位置