[发明专利]用于确定物源的组合物和方法

权利要求书

1.一种微生物，所述微生物被工程化为包含至少一种遗传条形码元件和以下中的至少一种：

a)至少一种必需基因的失活修饰；或者

b)至少一种萌发基因的失活修饰。

2.如权利要求1所述的经工程化微生物，其中，所述微生物被工程化为包含遗传条形码元件、至少一种必需基因的失活修饰以及至少一种萌发基因的失活修饰。

3.如权利要求1所述的经工程化微生物，其中，所述微生物被工程化为包含遗传条形码元件以及至少一种必需基因的失活修饰。

4.如权利要求1-3中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述微生物为酵母或细菌。

5.如权利要求1-4中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述微生物为酵母菌属酵母或芽孢杆菌属细菌。

6.如权利要求1-5中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述微生物为酿酒酵母、枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌。

7.如权利要求1-6中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述微生物由酿酒酵母菌株BY4743、枯草芽孢杆菌菌株168或苏云金芽孢杆菌菌株HD-73工程化而来。

8.如权利要求1-7中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述遗传条形码元件包含：

a)第一引物结合序列；

b)至少一个条形码区；

c)Cas酶支架；

d)转录起始位点；以及

e)第二引物结合序列。

9.如权利要求1-7中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述遗传条形码元件包含：

a)第一引物结合序列；

b)至少一个条形码区；

c)转录起始位点；以及

d)第二引物结合序列。

10.如权利要求1-7中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述遗传条形码元件包含：

a)第一引物结合序列；

b)至少一个条形码区；以及

c)第二引物结合序列。

11.如权利要求1-10中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述微生物被工程化为包含第一条形码区和第二条形码区。

12.如权利要求11所述的经工程化微生物，其中，所述第一条形码区指示，在其上检测到所述微生物的物品来自已知来源的组中的一个；并且所述第二条形码区指示，在其上检测到所述微生物的物品来自所述来源的组中的特定来源。

13.如权利要求8-12中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述第一引物结合序列和第二引物结合序列包含用于结合PCR或RPA引物的位点。

14.如权利要求8-13中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述条形码区包含20个-40个碱基对。

15.如权利要求8-14中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述条形码区包含相对于由权利要求1-14中任一项所述的经工程化微生物标志的其它物品所包含的条形码区而言至少5个碱基对的汉明距离。

16.如权利要求8-15中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述条形码区是独特的，或者与由权利要求1-15中任一项所述的经工程化微生物标志的其它物品所包含的至少一个其它条形码区可区分。

17.如权利要求8-16中任一项所述的经工程化微生物，其中，所述Cas酶支架包括Cas13的支架。