[发明专利]过滤人工智能设计的分子以进行实验室测试在审

专利信息
申请号: 202180033850.X 申请日: 2021-05-14
公开(公告)号: CN115552533A 公开(公告)日: 2022-12-30
发明(设计)人: P·达斯;F·奇普奇甘;K·瓦德哈万;I·帕迪;E·维吉尔;陈品谕;A·莫杰西洛维奇;T·塞尔屈;C·诺盖拉多斯桑托斯 申请(专利权)人: 国际商业机器公司
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30;G16C20/30;G16H20/13
代理公司: 北京市中咨律师事务所 11247 代理人: 于静;刘薇
地址: 美国*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 过滤 人工智能 设计 分子 进行 实验室 测试
【权利要求书】:

1.一种系统,包括:

存储器,其存储计算机可执行组件;

处理器,其执行存储在所述存储器中的所述计算机可执行组件,其中所述计算机可执行组件包括:

基于试探法的筛选组件,其使用一种或多种分类器评估人工智能(AI)设计分子的组以选择所述AI设计的分子的第一亚组作为候选药剂;以及

基于模拟的筛选组件,其使用所述候选药剂与一种或多种生物靶标之间的分子相互作用的一个或多个计算机模拟来评估所述候选药剂,以选择所述候选药剂的第二亚组用于湿式实验室测试。

2.如权利要求1所述的系统,其中所述一种或多种分类器包括一个或多个机器学习模型,所述机器学习模型基于所述AI设计的分子的分子序列将所述AI设计的分子分类为具有或不具有靶标药剂的一个或多个限定特征。

3.如权利要求2所述的系统,其中基于试探法的筛选组件基于具有所述一个或多个限定特征的所述第一亚组选择所述第一亚组。

4.如权利要求1所述的系统,其中所述一个或多个计算机模拟针对所述候选药剂和所述一种或多种生物靶标采用一个或多个力场模型。

5.如权利要求1所述的系统,其中所述基于模拟的筛选组件基于所述第二亚组在所述一个或多个计算机模拟中显示一个或多个靶分子相互作用特征来选择所述第二亚组。

6.如权利要求1所述的系统,其中所述候选药剂包括候选抗微生物剂,并且其中所述一种或多种分类器确定所述AI设计的分子是否是以下中的至少一个:抗微生物肽、广谱抗微生物、无毒或结构化的。

7.如权利要求6所述的系统,其中所述基于模拟的筛选组件采用所述一个或多个计算机模拟来评估所述候选抗微生物剂与模型脂质双层或病原体的另一种细胞组分以及力场之间的相互作用倾向。

8.如权利要求7所述的系统,其中所述基于模拟的筛选组件基于表现出限定水平的相互作用倾向的所述第二亚组来选择所述候选抗微生物剂的所述第二亚组用于实验室测试。

9.如权利要求6所述的系统,其中所述基于模拟的筛选组件采用初始计算机模拟来模拟具有有效和无活性序列的测试分子与模型脂质双层或病原体的另一种细胞组分之间的相互作用,并基于所述相互作用选择与抗微生物活性相关的一个或多个特征。

10.如权利要求9所述的系统,其中所述基于模拟的筛选组件基于所述候选抗微生物剂是否表现出使用所述一个或多个计算机模拟所确定的所述一个或多个特征来评估候选抗微生物剂以包括在所述第二亚组中。

11.如权利要求6所述的系统,其中所述湿式实验室测试包括以下中的至少一个:

测试所述第二亚组对抗一种或多种病原体,所述多个病原体包括革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌;或

测试所述第二亚组的毒性。

12.一种方法,包括:

由可操作地耦合到处理器的系统基于使用一种或多种分类器对人工智能(AI)设计分子进行分类,从所述AI设计的分子的组中选择所述AI设计的分子的第一亚组作为候选药剂;以及

通过所述系统,基于使用一个或多个计算机模拟对所述候选药剂与一种或多种生物靶标之间的分子相互作用的评估,选择所述候选药剂的第二亚组用于湿式实验室测试。

13.如权利要求12所述的方法,其中所述一种或多种分类器包括一个或多个机器学习模型,所述机器学习模型基于所述AI设计的分子的分子序列将所述AI设计的分子分类为具有或不具有靶标药剂的一个或多个限定特征。

14.根据权利要求13所述的方法,其中所述选择所述第一亚组包括基于具有所述一或多个限定特征的所述第一亚组来选择所述第一亚组。

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