[发明专利]使用糖-凝集素偶联来检测元素

说明书

本发明提供了一种用于检测元素的方法。该方法包括将元素‑糖复合物偶联至基底。该元素‑糖复合物包括偶联至糖的元素。该方法包括：将凝集素偶联至该糖；检测该凝集素；以及至少使用该凝集素的该检测来检测该元素。本发明提供了一种系统，该系统包括基底以及偶联至该基底的元素‑糖复合物。该元素‑糖复合物包括偶联至糖的元素。该系统包括偶联至该糖的凝集素；以及至少使用该凝集素的检测来检测该元素的检测电路。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2020年9月11日提交的并且名称为″Detecting Elements UsingSugar-Lectin Couplings″的美国临时专利申请号63/077,416的权益，该美国临时专利申请的全部内容以引用方式并入本文。

背景技术

生物样本中存在的特定核酸序列的检测已被用作例如鉴定和分类微生物、诊断传染病、检测和表征遗传异常、鉴定与癌症相关联的遗传变化、研究对疾病的遗传易感性以及测量对各种类型的治疗的反应的方法。用于检测生物样本中的特定核酸序列的常用技术是核酸测序。

核酸测序方法已从Maxam和Gilbert所使用的化学降解方法以及Sanger所使用的链延长方法得到了发展。现在使用了允许在单个芯片上并行处理数千个核酸的若干测序方法。一些平台包括基于小珠的形式和微阵列形式，其中二氧化硅小珠用探针官能化，这取决于此类形式在包括测序、基因分型或基因表达谱分析在内的应用中的应用。

一些测序系统使用基于荧光的检测，无论是用于″边合成边测序″还是用于基因分型，其中给定的核苷酸用荧光标签标记，并且基于检测来自该标签的荧光来鉴定核苷酸。

发明内容

在本文的一些示例中提供了一种用于检测元素的方法。该方法可包括将第一元素-糖复合物偶联至第一基底。第一元素-糖复合物包括偶联至第一糖的第一元素。该方法可包括将第一凝集素偶联至第一糖；以及至少使用第一凝集素的检测来检测第一元素。

在一些示例中，第一元素包括分析物。在一些示例中，分析物包括第一核苷酸。在一些示例中，将第一元素-糖复合物偶联至第一基底包括将第一核苷酸掺入偶联至第一基底的第一寡核苷酸中。在一些示例中，第一寡核苷酸与第二寡核苷酸杂交，并且将第一核苷酸掺入第一寡核苷酸中包括至少使用第二寡核苷酸的序列来延伸第一寡核苷酸。在一些示例中，将第一元素-糖复合物偶联至第一基底包括使溶液在基底上流动。溶液可包括第一元素-糖复合物；以及第二元素-糖复合物，该第二元素-糖复合物包括偶联至第二糖的第二元素。第一凝集素选择性地结合第一糖而不结合第二糖。第一元素和第二元素可包括彼此不同的核苷酸类型。在一些示例中，第一糖和第二糖包括彼此不同的糖类型。

在一些示例中，该方法还包括将该第二元素-糖复合物偶联至第一基底或偶联至第二基底；将第二凝集素偶联至第二糖；以及至少使用第二凝集素的检测来检测第二元素。在一些示例中，溶液还包括第三元素-糖复合物，该第三元素-糖复合物包括偶联至第三糖的第三元素；以及第四元素-糖复合物，该第四元素-糖复合物包括偶联至第四糖的第四元素。该方法还可包括将第三元素-糖复合物偶联至第一基底、偶联至第二基底或偶联至第三基底。该方法还可包括将第三凝集素偶联至第三糖；以及至少使用第三凝集素的检测来检测第三元素。该方法还可包括将第四元素-糖复合物偶联至第一基底、偶联至第二基底、偶联至第三基底或偶联至第四基底。该方法还可包括将第四凝集素偶联至第四糖；以及至少使用第四凝集素的检测来检测第四元素。

在一些示例中，第一元素糖-复合物还包括偶联至元素的第五糖。在一些示例中，该方法还包括将第一凝集素偶联至第五糖。