[发明专利]用于对独特表型进行索引分选的方法及用于其的系统

说明书

本公开的方面包括用于基于标识的顺序而采用流式细胞术对具有粒子(例如细胞)的样本进行分选的方法。根据特定实施例的方法包括：将所述样本引入流式细胞仪；使引入的所述样本在液流中流动；用光源照射所述液流中的所述样本；检测来自在所述液流中流动的所述样本中的细胞的光；基于从检测的光生成的一个或更多个数据信号而标识在所述液流中流动的所述样本中的细胞的表型；以及基于标识的顺序将所述样本中的具有预定表型的集合中的表型的细胞动态地分选到分区中。还提供了用于实践主题方法的系统。还描述了非暂时性计算机可读存储介质。

相关申请的交叉引用

根据35 U.S.C.§119(e)，本申请要求于2020年4月28日提交的美国临时专利申请序列号63/016,702的提交日的优先权，该申请的公开内容通过引用并入本文。

背景技术

流式粒子分选系统(例如进行分选的流式细胞仪)被用于基于粒子的至少一个测量的特性来分选流体样本中的粒子。在流式粒子分选系统中，流体悬浮液中的粒子(例如分子、结合分析物的小珠或各个细胞)以流的形式经过传感器检测流中包含的要被分选的类型的粒子的检测区。当检测到要被分选的类型的粒子时，传感器触发选择性地分离感兴趣的粒子的分选机构。例如，经分选的感兴趣的粒子被分离到分区(例如样本容器、试管或多孔板的孔)中。

粒子感测通常通过以下步骤来执行：使流体流经过粒子暴露于来自一个或更多个激光器的照射光的检测区；以及测量粒子的光散射和荧光性质。粒子或其成分可以用荧光染料来标记以促进检测，并且可以通过将光谱上不同的荧光染料用于标记不同的粒子或成分来同时检测多种不同的粒子或成分。使用一个或更多个光电传感器执行检测以促进各个不同的荧光染料的荧光的独立的测量。

为了分选样本中的粒子，在液流的中断点处，液滴充电机构利用电荷对包含要被分选的类型的粒子的液流的液滴进行充电。液滴经过静电场并且基于液滴上的电荷的极性和幅度而偏转到一个或更多个分区(例如样本采集容器)中。未充电的液滴不被静电场偏转。

发明内容

本公开的方面包括用于基于标识的顺序而采用流式细胞术对具有粒子(例如细胞)的样本进行分选的方法。根据特定实施例的方法包括：将所述样本引入流式细胞仪；使引入的所述样本在液流中流动；用光源照射所述液流中的所述样本；检测来自在所述液流中流动的所述样本中的细胞的光；基于从检测的光生成的一个或更多个数据信号而标识在所述液流中流动的所述样本中的细胞的表型；以及基于标识的顺序将所述样本中的具有预定表型的集合中的表型的细胞动态地分选到分区中。还提供了用于实践主题方法的系统。还描述了非暂时性计算机可读存储介质。

在一些实施例中，在分选预定数量的具有第一表型的细胞之后，从表型的集合中排除所述第一表型。在其他实施例中，将预定数量的细胞分选到分区中。在每个实例中，所述预定数量的细胞可以是例如1或2或10或100或更多。

在一些实施例中，所述分区包括孔。例如，所述孔可以是多孔板的孔。在一些实施例中，在将预定数量的细胞分选到第一孔中之后将所述多孔板向前移动到第二孔。所述预定数量的细胞可以是例如1或2或10或100或更多。

在一些实施例中，记录分选到分区中的细胞的表型。分选到分区中的细胞的表型可以通过例如将细胞表型的表示添加到列表、概率数据结构、关联数组或真值表来记录。在一些实例中，在分选细胞之前，查询以前分选的表型的记录。在实施例中，可以查询表型的列表或概率数据结构或关联数组或真值表以确定是否已经分选第一细胞，其中，第一细胞具有也由第二细胞表现出的表型。在一些实例中，所述概率数据结构可以是布隆过滤器。在这些实例中，基于样本的分析来选择结合所述布隆过滤器使用的哈希函数以减少所述布隆过滤器中的冲突。在一些实施例中，所述关联数组是内容可寻址的存储器。

在一些实施例中，对标识分区和分选到该分区中的细胞的表型的信息进行记录。例如，可以维护标识分区和分选到该分区中的细胞的表型的列表。在一些实施例中，基于所述样本中的细胞的子集对由所述样本中的细胞表现出的表型的数量做出估计。