[发明专利]用于基因组结构分析的装置和方法

权利要求书

1.一种用于分析长核酸分子的方法，所述方法包括：(a)通过将所述分子的至少一部分暴露于至少一种变性条件，使所述长核酸分子的至少一部分部分变性；(b)使在第一导电液体介质和第二导电液体介质之间的所述长核酸分子的至少一部分移位通过至少一个收缩装置的至少一个收缩区域；(c)当所述核酸分子与所述至少一个收缩装置的至少一个收缩区域相互作用时，探查与所述至少一个收缩装置相关的至少一个信号；以及(d)由所述至少一个信号确定沿着所述长核酸分子的至少一部分的分箱变性谱。

2.根据权利要求1所述的方法，其中测量通过所述收缩区域的离子电流以产生所述信号。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一个收缩装置包括电极间隙，所述电极间隙与所述装置的收缩区域足够接近，以致移位通过所述收缩区域的所述长核酸分子也在所述电极间隙之间移位，使得可以进行电测量以产生所述信号。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一个收缩装置包括传感器，所述传感器与所述装置的收缩区域足够接近，使得移位通过所述收缩区域的所述分子将被所述传感器感测，产生所述信号。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述传感器包括晶体管。

6.根据权利要求4所述的方法，其中所述传感器包括官能化表面。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述收缩装置的收缩部是有形的。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述收缩装置的收缩部是无形的。

9.根据权利要求1所述的方法，其中所述信号在所述收缩装置的收缩区域中捕获。

10.根据权利要求1所述的方法，其中所述信号在所述收缩装置的收缩区域附近捕获。

11.根据权利要求1所述的方法，其中由部分解链的长核酸分子的部分产生的信号可测量地不同于由处于完全杂交状态的所述分子的相同部分产生的信号。

12.根据权利要求1所述的方法，其中所述变性条件包括温度。

13.根据权利要求1所述的方法，其中所述变性条件包括试剂。

14.根据权利要求1所述的方法，其中所述变性条件包括离子强度。

15.根据权利要求1所述的方法，其中所述变性条件包括pH。

16.根据权利要求1所述的方法，其中所述变性条件被调节。

17.根据权利要求16所述的方法，其中所述变性条件在所述探查期间被调节。

18.根据权利要求16所述的方法，其中所述变性条件在对所述分子的多于一个探查事件之间被调节。

19.根据权利要求16所述的方法，其中所述变性条件被调节以增加所述长核酸分子的至少一部分的分箱变性谱的独特性。

20.根据权利要求16所述的方法，其中所述调节由反馈系统控制，其中至少一个输入参数是来自所述收缩装置的信号。

21.根据权利要求1所述的方法，其中所述收缩区域的第一侧具有第一变性条件，并且所述收缩区域的第二侧具有第二变性条件，并且其中所述第一变性条件和所述第二变性条件是不同的。