[发明专利]用于对微集落中生长的微生物细胞进行分类的系统和方法在审
申请号: | 202180057652.7 | 申请日: | 2021-06-25 |
公开(公告)号: | CN116472335A | 公开(公告)日: | 2023-07-21 |
发明(设计)人: | 萨马德·泰勒普尔;安娜·希姆琴科;玛丽亚姆·阿萨迪谢卡里;斯蒂芬·韦斯利·伦纳德 | 申请(专利权)人: | 克维拉公司 |
主分类号: | C12M1/00 | 分类号: | C12M1/00 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 加拿大*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 集落 生长 微生物 细胞 进行 分类 系统 方法 | ||
1.一种对微集落进行分类的方法,所述方法包含:
采用数值孔径在0.15与0.35之间的暗视野物镜获取所述微集落的暗视野图像,所述微集落位于固相生长培养基上;以及
处理所述暗视野图像,以基于所述微集落的形态特征将所述微集落分类为两种或更多种微生物细胞类型类别。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,在微集落生长阶段期间获取所述暗视野图像,所述微集落生长阶段表征为所述微集落的暗视野形态的时间依赖性变化。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述暗视野物镜的数值孔径介于0.18与0.32之间。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述暗视野物镜的数值孔径介于0.16与0.28之间。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,在所述微集落具有200微米的有效直径之前获取所述暗视野图像。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中,所述微集落通过以下步骤制备:
将微生物细胞接种到所述固相生长培养基上;
在适于促进所述微生物细胞生长和微集落产生的条件下孵育所述固相生长培养基。
7.根据权利要求6的方法,其中,所述固相生长培养基包含浓度介于1%w/v与2.5%w/v之间的琼脂。
8.根据权利要求6的方法,其中,所述固相生长培养基包含浓度为介于1.5%w/v与2.25%w/v之间的琼脂。
9.根据权利要求6的方法,其中,所述固相生长培养基包含浓度为介于1.35%w/v与2%w/v之间的琼脂。
10.根据权利要求6至9中任一项所述的方法,其中,通过使悬浮液与所述固相生长培养基接触而将所述微生物细胞接种到所述固相生长培养基上,所述悬浮液包含所述微生物细胞。
11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述悬浮液在没有介入生长步骤的情况下来源于全血样品。
12.根据权利要求6至9中任一项所述的方法,其中,所述微集落是第一微集落,所述微生物细胞是第一微生物细胞,所述固相生长培养基是具有第一组成的第一固相生长培养基,所述暗视野图像是第一暗视野图像,并且其中通过使悬浮液的第一等分试样与所述固相生长培养基接触将所述微生物细胞接种到所述第一固相生长培养基上,所述悬浮液的第一等分试样包含所述第一微生物细胞,所述方法还包含:
使所述悬浮液的第二等分试样与第二固相生长培养基接触,所述悬浮液的第二等分试样包含第二微生物细胞,所述第二固相生长培养基具有不同于所述第一组成的第二组成;
在适于促进所述第二微生物细胞生长和第二微集落产生的条件下孵育所述固相生长培养基;以及
获取第二暗视野图像,所述第二暗视野图像表征所述第二微集落的暗视野形态;
其中处理所述第一暗视野图像和所述第二暗视野图像以对所述微集落进行分类。
13.根据权利要求6至12中任一项所述的方法,其中,从将所述微生物细胞接种到所述固相生长培养基上的时间起3至5小时内获得所述微集落的暗视野图像。
14.根据权利要求6至13中任一项所述的方法,其中,在将相对湿度维持于30%与70%之间时,孵育所述固相生长培养基。
15.根据权利要求6至13中任一项所述的方法,其中,在将相对湿度维持于30%与99%之间时,孵育所述固相生长培养基。
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