[发明专利]用于测定蛋白质和核酸的组合物和方法

权利要求书

1.一种用于分析来自对象的生物样本的方法，其包括：

(a)测定来自所述对象的所述生物样本，以鉴定所述生物样本中的蛋白质从而获得所述生物样本的蛋白质组信息；

(b)分析来自所述生物样本的核酸分子，以鉴定所述生物样本的基因型信息；和

(c)基于所述蛋白质组信息和所述基因型信息，鉴定所述对象的肽变体或基因组变体，其中在(a)或(b)中分别无法鉴定所述肽变体或所述基因组变体。

2.根据权利要求1所述的方法，其中(a)包括使所述生物样本经受鉴定所述生物样本中的所述蛋白质的测定。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中(a)包括在足以将所述蛋白质从所述生物样本吸附到颗粒的条件下，使所述生物样本与所述颗粒接触。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述蛋白质在所述颗粒上具有压缩的动态范围。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述颗粒包括具有不同物理化学性质的多种颗粒。

6.根据权利要求5所述的方法，其中所述多种颗粒包括以下中的至少两种：二氧化硅涂覆的SPION、PDMAPMA-聚合物官能化的纳米颗粒、葡萄糖-6-磷酸酯官能化的纳米颗粒、聚苯乙烯羧基官能化的纳米颗粒、葡聚糖官能化的纳米颗粒、混合酰胺和羧酸酯官能化的二氧化硅涂覆的纳米颗粒、三胺官能化的纳米颗粒、二胺官能化的纳米颗粒或单胺官能化的纳米颗粒。

7.根据权利要求5所述的方法，其中所述多种颗粒包括以下中的至少两种：二氧化硅涂覆的SPION、PDMAPMA-聚合物官能化的纳米颗粒、葡萄糖-6-磷酸酯官能化的纳米颗粒、聚苯乙烯羧基官能化的纳米颗粒、葡聚糖官能化的纳米颗粒、混合酰胺和羧酸酯官能化的二氧化硅涂覆的纳米颗粒、N-(3-三甲氧基甲硅烷基丙基)二亚乙基三胺涂覆的纳米颗粒、N¹-(3-(三甲氧基甲硅烷基)丙基)己烷-1,6-二胺官能化的纳米颗粒或1,6-己二胺官能化的纳米颗粒。

8.根据权利要求6所述的方法，其中由所述多种颗粒中的第一颗粒吸附的所述蛋白质的第一蛋白质子集包括与由所述多种颗粒中的第二颗粒吸附的所述蛋白质的第二蛋白质子集共有的至多80％的蛋白质类型。

9.根据权利要求3所述的方法，其中所述蛋白质包括约50至500种类型的蛋白质或蛋白质群组。

10.根据权利要求6-8中任一项所述的方法，其中所述蛋白质包括约250至25000种类型的蛋白质或蛋白质群组。

11.根据权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述对象包括一名对象。

12.根据权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述对象包括多名对象。

13.根据权利要求8-12中任一项所述的方法，其中所述蛋白质占所述生物样本中所述蛋白质类型的0.2％至2％。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中(a)包括鉴定所述生物样本中所述蛋白质的丰度。

15.根据权利要求1-14中任一项所述的方法，其中所述核酸分子包括无细胞脱氧核糖核酸(cfDNA)、无细胞核糖核酸(cfRNA)或其任何组合。

16.根据权利要求15所述的方法，其中(b)包括将所述核酸分子鉴定为包括基因组DNA、线粒体DNA(mtDNA)、循环肿瘤DNA(ctDNA)或其任何组合。

17.根据权利要求16所述的方法，其中(b)包括鉴定所述ctDNA的细胞类型、癌症类型、癌症阶段或其任何组合。