[发明专利]细菌性呼吸道病原体的多重检测

权利要求书

1.一种检测样品中的肺炎链球菌(S.pneumoniae)和脑膜炎奈瑟菌(N.meningitidis)的方法，所述方法包括：

使所述样品与多于一对引物接触，其中所述多于一对引物包含：

能够与肺炎链球菌的lytA基因杂交的至少一对引物，其中所述至少一对引物中的每种引物包含SEQ ID NO:1-10的序列中的任一个，或与SEQ ID NO:1-10的序列中的任一个显示至少约85％同一性的序列；

能够与肺炎链球菌的cpsA基因杂交的至少一对引物，其中所述至少一对引物中的每种引物包含SEQ ID NO:16-25的序列中的任一个，或与SEQ ID NO:16-25的序列中的任一个显示至少约85％同一性的序列；

能够与脑膜炎奈瑟菌的sodC基因杂交的至少一对引物，其中所述至少一对引物中的每种引物包含SEQ ID NO:31-39的序列中的任一个，或与SEQ ID NO:31-39的序列中的任一个显示至少约85％同一性的序列；以及

能够与脑膜炎奈瑟菌的crtA基因杂交的至少一对引物，其中所述至少一对引物中的每种引物包含SEQ ID NO:45-54的序列中的任一个，或与SEQ ID NO:45-54的序列中的任一个显示至少约85％同一性的序列；

如果所述样品包含肺炎链球菌和脑膜炎奈瑟菌中的一种或两种，则从所述样品产生肺炎链球菌的lytA基因序列的扩增子、肺炎链球菌的cpsA基因序列的扩增子、脑膜炎奈瑟菌的sodC基因序列的扩增子、脑膜炎奈瑟菌的crtA基因序列的扩增子或其任何组合；并且

确定一种或更多种扩增子的存在或量，作为所述样品中肺炎链球菌和脑膜炎奈瑟菌中的一种或两种的存在的指示。

2.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括使所述样品与能够与添加到所述样品中的内部扩增对照(IAC)杂交的至少一对对照引物接触，其中所述至少一对对照引物中的每种引物包含SEQ ID NO:60-69和130-132的序列中的任一个，或与SEQ ID NO:60-69和130-132的序列中的任一个显示至少约85％同一性的序列，以及

从所述样品产生所述IAC的扩增子；并且

确定所述IAC的扩增子的存在或量，作为用所述样品进行的测定的性能的指示。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述样品与包含所述多于一对引物和能够与IAC杂交的所述至少一对对照引物的组合物接触。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述样品是生物样品或环境样品。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述环境样品从以下获得：食品样品、饮料样品、纸张表面、织物表面、金属表面、木材表面、塑料表面、土壤样品、淡水样品、废水样品、盐水样品、暴露于环境空气或其他气体的样品、其培养物或其任何组合。

6.根据权利要求4所述的方法，其中所述生物样品从以下获得：组织样品、唾液、血液、血浆、血清、粪便、尿液、痰、黏液、淋巴、滑液、脑脊液、腹水、胸腔积液、血清肿、脓、皮肤或黏膜表面的拭子、其培养物或其任何组合。

7.根据权利要求4所述的方法，其中所述生物样品包括血液样品、呼吸道样品和/或其培养物。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述多于一对引物包含含有SEQ IDNO:1、3、5、7或9的序列的第一引物，含有SEQ ID NO:2、4、6、8或10的序列的第二引物，含有SEQ ID NO:16、18、20、22或24的序列的第三引物，含有SEQ ID NO:17、19、21、23或25的序列的第四引物，含有SEQ ID NO:31、33、35、36或38的序列的第五引物，含有SEQ ID NO:32、34、37或39的序列的第六引物，含有SEQ ID NO:45、47、49、51或53的序列的第七引物，以及含有SEQ ID NO:46、48、50、52或54的序列的第八引物。