[发明专利]结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法

说明书

本发明公开结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法，生物标志物包括内脏奥德氏杆菌Odoribacter splanchnicus_62174、解纤维素拟杆菌Bacteroides cellulosilyticus_58046等；筛选方法包括：S1、获取疾病和正常对照组微生物测序数据及临床信息数据，并进行预处理；S2、数据进行筛选，对具有足够测序深度和覆盖度的菌株进行SNV水平的注释，获得每个菌株的SNV突变频率等信息；S3、对疾病患者和健康对照组的微生物SNV数据进行差异分析，获得不同菌株中差异显著的SNV位点；S4、筛选，确定SNV最优生物标志物；本发明提供的生物标志物及筛选方法更好地进行癌症早诊早治，具有重要的意义和临床应用价值。

技术领域

本发明涉及医药技术领域，具体是结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法。

背景技术

近年来，世界癌症发病率和死亡率呈逐年上升趋势，对肿瘤的早期筛查与早期干预可以有效降低其发病率与死亡率。

以结直肠癌为例，在全世界范围内，约10％的新确诊癌症为结直肠癌，给全球社会带来了巨大的健康和经济负担。结直肠腺瘤是结直肠癌最主要的癌前病变，在结直肠腺瘤阶段进行癌症的早期筛查和干预可以显著降低结直肠癌的发病率，提高患者的五年生存率，具有重大的临床意义。当前对结直肠肿瘤进行筛查的主要手段包括影像学检查、内镜、免疫粪便潜血检测等，但这些手段存在具有放射性损害、高侵入、灵敏度较低和依从性较低等局限，迫切需要技术革新。

肠道菌群，作为人体肠道内微生物群落的总称，与多种疾病密切相关，是近年来肿瘤筛查，尤其是消化道肿瘤筛查和早期诊断的重要生物标志物。基于肠道菌群对结直肠肿瘤进行早筛的研究大多采用肠道微生物的丰度，例如根据细菌丰度来进行诊断模型的构建，但这些方法存在一定的局限性。

单核苷酸变异(Single-Nucleotide Variant,SNV)作为最常见的遗传变异类型，与微生物的结构、功能等密切相关，对肠道微生物的稳态维持至关重要。近年来研究表明，微生物SNV可以用于诊断多种疾病，是一种新颖且有价值的肿瘤早筛生物标志物。SNV有望成为肿瘤早筛的潜在诊断标志物，用于早筛模型的构建，亟待研究。

发明内容

本发明提供了结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法。对于更好地进行癌症早诊早治，具有重要的意义和临床应用价值。

为达此目的，本发明提供如下的技术方案：