[发明专利]基于DNA支点介导链置换反应技术的非线性神经网络在审

专利信息
申请号: 202210012614.6 申请日: 2022-01-07
公开(公告)号: CN114386574A 公开(公告)日: 2022-04-22
发明(设计)人: 邹成业;张强;王鹏飞 申请(专利权)人: 大连理工大学
主分类号: G06N3/04 分类号: G06N3/04;G06N3/06;G06N3/08;G16B40/00;C12Q1/6844
代理公司: 大连理工大学专利中心 21200 代理人: 戴风友
地址: 116024 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 基于 dna 支点 介导链 置换反应 技术 非线性 神经网络
【权利要求书】:

1.基于DNA支点介导链置换反应技术的非线性神经网络,其特征在于,描述如下形式:

其中n=1,2,…,L;j=1,2,…,M;Xi、Yj、Win和Vnj为信号参与物,Xi和Yj的浓度表征输入数据,Win和Vnj的浓度代表输入层和隐藏层部分的权值;ks,s=1,…,14为反应速率;非线性神经网络由输入层、隐藏层和输出层三部分组成,其中反应(1)、(2)、(9)和(11)构成了输入层,反应(3)、(4)、(5)、(6)、(10)和(12)构成了隐藏层,反应(7)、(8)和(13)构成了输出层。

2.如权利要求1所述的基于DNA支点介导链置换反应技术的非线性神经网络,其特征在于,所述的反应方程(1)-(13)由不同的反应模块构成,其中方程(1)和(5)属于催化反应模块1;方程(1)和(5)属于催化反应模块1;方程(2)、(4)、(6)和(8)属于降解反应模块;方程(9)和(10)属于调节反应模块1;方程(11)-(13)属于催化反应模块2;上述反应模块可由如下的DNA链置换反应实现:

(I)催化反应模块1:

催化反应模块1的理想化反应方程为:它可由如下DNA链置换反应得到:

其中Ii被催化,Xi为信号DNA链,Wi为权值报告链Ai、Pai、Pci和Pdi为辅助DNA链,且辅助DNA链的初始浓度为Cm,并满足Cm≥[Xi]0,[Wi]0,[Ii]0,[*]0表示*的初始浓度;反应速率qi和ki满足qi≤qm,ki=qi,qm表示最大反应速率;

(II)催化反应模块2:

催化反应模块2的理想化反应方程为:它可由如下DNA链置换反应得到:

其中Ii被催化,Xi为信号DNA链,Gai,Ei,Fi,Gdi,Gei,Ji及Ki为辅助DNA链,且辅助DNA链的初始浓度为Cm,并满足Cm≥[Yi]0,[Ii]0;反应速率qi满足qi≤qm,ki=qi

(III)降解反应模块:

降解反应模块2的理想化反应方程为:它可由如下DNA链置换反应得到:

其中Ii被降解,Fai,Ci,Fci及Fdi为辅助DNA链,且辅助DNA链的初始浓度为Cm,并满足Cm≥[Yi]0,[Ii]0;反应速率qi满足qi≤qm,ki=qi

(IV)调节反应模块1:

调节反应模块1的理想化反应方程为:它可由如下DNA链置换反应得到:

其中Wi的浓度被调节,Eai及Ebi为信号DNA链,且它们之间的浓度满足[Wi]0<<[Ebi]0和[Eai]0<<[Ebi]0;反应速率满足kai=qai和kbi=qbi

(V)调节反应模块2:

调节反应模块2的理想化反应方程为:它可由如下DNA链置换反应得到:

其中Yi的浓度被调节,Lai及Lbi为信号DNA链,且它们之间的浓度满足[Yi]0,[Lai]0<<[Lbi]0;反应速率满足kxi=qxi和kyi=qyi

3.如权利要求1或2所述的基于DNA支点介导链置换反应技术的非线性神经网络,其特征在于,所述的非线性神经网络的训练方式如下:

(1)训练数据的归一化处理

神经网络的训练由多轮训练构成,一轮训练由K组训练数据组成,打乱训练数据组,得到另一轮训练数据;第一轮训练数据由Xi=[xi(1,1),xi(2,1),…,xi(K,1)]表示,则可按如下方法进行数据归一化:

其中

xi(k,l)表示第l轮训练的第k组数据的第i个数据,其中k=1,2,…,K,l=1,2,…,Λ,ρ为正调节参数,及为神经网络的输入信号DNA链的初始浓度设定;

(2)神经网络的训练评估

在一轮训练中,定义相对误差el(k)如下:

其中

Win及Vn1表示经过本轮训练以后,得到的输入层和隐藏层的权值;

为评估本轮训练结果,定义平均相对误差如下:

进过多轮训练以后,当平均相对误差达到目标值以后,则停止训练。

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