[发明专利]一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路及其应用有效
申请号: | 202210015915.4 | 申请日: | 2022-01-07 |
公开(公告)号: | CN114369642B | 公开(公告)日: | 2023-10-27 |
发明(设计)人: | 范小波;吴国球 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/70;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京同辉知识产权代理事务所(普通合伙) 11357 | 代理人: | 赵丹 |
地址: | 210096 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 催化 核酸 组装 逻辑 环路 及其 应用 | ||
1.一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路,其特征在于,由3条自组装发卡链和1条催化起始链混合杂交形成;
所述自组装发卡链包括B链、C链和D链;催化起始链为A链;
所述A链的序列为:5’-AAACUUCCGAACGGUCCCAGCAU-3’。
2.根据权利要求1所述的一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路,其特征在于,反应起始:A链和B链杂交启动自组装;B链和A链杂交后形成游离单链暴露出与C链、D链结合的区域,并与C链和D链杂交再次形成游离的核酸单链,游离的核酸单链可与B链再次杂交;杂交后的B链游离序列可再次与C链、D链杂交,由此形成一个闭合的超支化的自我催化逻辑环路。
3.根据权利要求1或2所述的一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路,其特征在于,所述A链由c’-d’-p’结构域组成。
4.根据权利要求1或2所述的一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路,其特征在于,所述
所述B链由d’-a’-b’-m1-m2-b-a-p-d-c-n1-n2-c’-d’-a’结构域组成;
所述C链由m1-b-a-d-n1’-c’-d’-p’-a’-b’-m2’结构域组成;
所述D链由n1’-c’-d’-p’-a’-b’-m2’-a-d-c-n2’结构域组成;
A链、B链、C链和D链的核酸序列均按5‘→3’排列顺序。
5.根据权利要求4所述的一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路,其特征在于,核酸序列组成:a和a’互补,b和b’互补,c和c’互补,d和d’互补,p和p’互补,m1和m1’互补,m2和m2’互补,n1和n1’互补,n2和n2’互补;b、c、m2和n1结构域序列长度均不多于10个核苷酸;a、b、c、d、p、m1和n2结构域均含有5-30个核苷酸;以上序列除互补配对外,各序列之间连续配对残基少于3个。
6.根据权利要求4所述的一种无酶催化的核酸自组装逻辑环路,其特征在于,所述结构域之间可以随机插入1-3个核苷酸。
7.根据权利要求1-2任意一项所述的逻辑环路的应用,其特征在于,逻辑环路应用于临床单链核酸的检测。
8.根据权利要求1-2任意一项所述的逻辑环路的应用,其特征在于,逻辑环路用于DNA单链、RNA单链以及环状单链DNA和RNA的检测。
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