[发明专利]一种编码MITF基因突变体的核酸及其应用在审
申请号: | 202210031046.4 | 申请日: | 2022-01-12 |
公开(公告)号: | CN114317550A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
发明(设计)人: | 雷冬竹;向嘉乐;张昊晴;李彩云;唐金勇;宋娜娜;彭智宇 | 申请(专利权)人: | 郴州市第一人民医院;深圳华大基因股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/6883;G01N33/68;G01N27/62;A61K49/00;A61K45/00;A61P27/16;G16B20/50 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张立娜 |
地址: | 423000 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 编码 mitf 基因 突变体 核酸 及其 应用 | ||
本发明公开了一种编码MITF基因突变体的核酸及其应用。本发明提供的核酸与野生型MITF基因相比,具有c.481CT突变。本发明发现了常染色体显性耳聋致病基因MITF的1个新的致病突变(c.481CT),该突变位点可用于常染色体显性耳聋患者的分子诊断及与相关疾病的鉴别诊断,并且快速、准确、高效、简便、早期诊断率高,检测结果可以为常染色体显性耳聋的早期诊断、鉴别诊断及药物治疗提供科学依据。
技术领域
本发明涉及生物医学领域,具体涉及一种编码MITF基因突变体的核酸及其应用。
背景技术
耳聋(hearing loss,HL)是最常见的感官功能障碍类疾病,相当一部分的耳聋患者的发病与遗传因素有关。通过基因检测手段确定耳聋发病的分子机制,从而进一步采取产前基因诊断和干预措施,是降低耳聋发生率的有效手段,也是耳聋防治的根本途径之一。根据是否有并发的其他临床表型,遗传性耳聋可分为综合征型耳聋(syndromic hearingloss,SHL)和非综合征型耳聋(non-syndromic hearing loss,NSHL)。
综合征型耳聋在先天性遗传性耳聋中占比30%左右,由不同致病基因导致的综合征型耳聋在发病年龄、听力损失程度、进行性等方面存在明显差异。确定耳聋发病的致病基因有助于为患者选取合适的听力干预手段,更好地提高耳聋患者的生活质量。
MITF基因位于3p13区域,包括9个外显子。MITF基因突变会导致Waardenburg综合症2A型和Tietz albinism-deafness综合征,临床表型包括耳聋,色素沉着异常(头发,皮肤,眼睛)。
发明内容
本发明的目的是提供一种编码MITF基因突变体的核酸,其为一个尚未公开的遗传性耳聋致病突变,可作为耳聋筛查产品的候选筛查位点开发诊断试剂盒、诊断芯片等,可增加临床突变数据库数据量。
第一方面,本发明要求保护一种核酸。
本发明要求保护的核酸与野生型MITF基因(cDNA)相比,具有c.481CT突变。
进一步地,所述核酸为DNA。
进一步地,所述核酸除了第481位核苷酸以外,其他部分与所述野生型MITF基因(cDNA)的序列相同。
所述野生型MITF基因(cDNA)如Genbank登录号为NM_000248.4(up date:PRI 31-OCT-2021)的第132-1391位所示。
本发明要求保护的所述核酸的序列具体如SEQ ID No.1所示(即具有c.481CT突变位点的MITF基因的cDNA)。
第二方面,本发明要求保护一种蛋白。
本发明要求保护的蛋白与由野生型MITF基因表达的蛋白相比,在氨基酸161位置发生了编码蛋白提前终止(即p.Gln161Ter)。
即,本发明请求保护的所述蛋白的氨基酸序列为所述由野生型MITF基因(cDNA)表达的氨基酸的第1-160位。
本发明请求保护的所述蛋白的氨基酸序列具体如SEQ ID No.2所示。
第三方面,本发明要求保护用于检测前文第一方面中所述的核酸或前文第二方面中所述的蛋白的试剂在制备试剂盒中的用途;所述试剂盒用于诊断或筛查综合征型耳聋。
进一步地,所述综合征型耳聋为常染色体显性综合征型耳聋。
更进一步地,所述常染色体显性综合征型耳聋由MITF基因cDNA序列的第481位由C突变为T所引起
进一步地,所述试剂可为抗体、探针、引物对和质谱检测试剂等中的至少一种。
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