[发明专利]菌群移植配型的排序方法、系统、计算机设备及存储介质有效

专利信息
申请号: 202210034606.1 申请日: 2022-01-12
公开(公告)号: CN114496279B 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 王科;黄伟斌 申请(专利权)人: 广州保量医疗科技有限公司
主分类号: G16H50/70 分类号: G16H50/70;G16H50/50
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 钟文瀚
地址: 510030 广东省广州市黄埔区国*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 移植 排序 方法 系统 计算机 设备 存储 介质
【权利要求书】:

1.菌群移植配型的排序方法,其特征在于,包括:

建立配型训练集和菌群移植配型排序模型,使用所述配型训练集对所述菌群移植配型排序模型进行训练;所述配型训练集的公式表示为:

Ψ={(s,t),score}∈Rn×R

式中,s和t分别为由n/2个元素组成的肠道菌群数据特征向量,分别代表受体数据和供体数据,score为一个实数,表示受体数据和供体数据的匹配度,R为训练集特征向量;

建立供体数据搜索引擎,将训练好的所述菌群移植配型排序模型部署到所述供体数据搜索引擎的前端,所述供体数据搜索引擎的数据库为供体数据库;

将待配型受体数据输入所述供体数据搜索引擎,通过训练好的所述菌群移植配型排序模型,对所述待配型受体数据与所述供体数据库中的供体数据进行匹配度打分排序,得到所述待配型受体数据与所述供体数据的匹配排序结果;

所述供体数据搜索引擎将所述匹配排序结果作为所述待配型 受体数据的配型搜索结果进行输出。

2.根据权利要求1所述的菌群移植配型的排序方法,其特征在于,所述菌群移植配型排序模型使用的打分排序方法为Pointwise方法。

3.根据权利要求1所述的菌群移植配型的排序方法,其特征在于,使用PRank算法对所述菌群移植配型排序模型进行训练。

4.菌群移植配型的排序系统,其特征在于,包括:

排序模型生成模型,用于建立配型训练集和菌群移植配型排序模型,使用所述配型训练集对所述菌群移植配型排序模型进行训练;所述配型训练集的公式表示为:

Ψ={(s,t),score}∈Rn×R

式中,s和t分别为由n/2个元素组成的肠道菌群数据特征向量,分别代表受体数据和供体数据,score为一个实数,表示受体数据和供体数据的匹配度,R为训练集特征向量;

搜索引擎生成模型,用于建立供体数据搜索引擎,将训练好的所述菌群移植配型排序模型部署到所述供体数据搜索引擎的前端,所述供体数据搜索引擎的数据库为供体数据库;

匹配结果生成模型,用于将待配型受体数据输入所述供体数据搜索引擎,通过训练好的所述菌群移植配型排序模型,对所述待配型受体数据与所述供体数据库中的供体数据进行匹配度打分排序,得到所述待配型受体数据与所述供体数据的匹配排序结果;

搜索结果输出模型,用于所述供体数据搜索引擎将所述匹配排序结果作为所述待配型受体数据的配型搜索结果进行输出。

5.根据权利要求4所述的菌群移植配型的排序系统,其特征在于,所述菌群移植配型排序模型使用的打分排序方法为Pointwise方法。

6.根据权利要求4所述的菌群移植配型的排序系统,其特征在于,使用PRank算法对所述菌群移植配型排序模型进行训练。

7.一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至3中任一项所述方法的步骤。

8.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至3中任一项所述的方法的步骤。

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