[发明专利]抗癌候选药物的ADMET性质预测方法及系统在审

专利信息
申请号: 202210038492.8 申请日: 2022-01-13
公开(公告)号: CN114496304A 公开(公告)日: 2022-05-13
发明(设计)人: 王红;郑子希 申请(专利权)人: 山东师范大学
主分类号: G16H70/40 分类号: G16H70/40;G16C20/30;G16C20/70
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 张庆骞
地址: 250014 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 抗癌 候选 药物 admet 性质 预测 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种抗癌候选药物的ADMET性质预测方法,其特征在于,包括:

获取抗癌候选药物化合物分子描述符信息;

对抗癌候选药物化合物分子描述符信息进行多特征提取,筛选出决定ADMET化合物性质的关键特征;

对筛选出的关键特征进行ADMET性质分类预测,得到抗癌候选药物的ADMET性质预测结果。

2.如权利要求1所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法,其特征在于,基于随机森林集成模型对抗癌候选药物化合物分子描述符信息进行多特征提取。

3.如权利要求1所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法,其特征在于,基于抗癌候选药物化合物各个分子描述符与提取的各个特征的之间的相关性,来确定出ADMET化合物性质的关键特征。

4.如权利要求3所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法,其特征在于,筛选出决定ADMET化合物性质的关键特征的过程为:

基于设定特征重要性公式来计算每个特征的重要性,并按降序排序;

依据特征重要性剔除预设剔除比例的特征,得到一个新的特征集;

对新的特征集重复上述重要性排序及特征剔除过程,直到剩下预设数量的特征;

根据得到的各个特征集和特征集对应的袋外误差率,选择袋外误差率最低的特征集,以作为决定ADMET化合物性质的关键特征。

5.如权利要求1所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法,其特征在于,采用性质预测模型对筛选出的关键特征进行ADMET性质分类预测;其中,所述性质预测模型为支持向量机。

6.如权利要求1所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法,其特征在于,所述ADMET化合物性质包括Caco-2、CYP3A4、hERG、HOB和MN的性质;其中,Caco-2表示化合物小肠上皮细胞的渗透性,CYP3A4表示化合物是否能够被CYP3A4代谢,hERG表示化合物是否具有心脏毒性,HOB表示化合物的口服生物利用度,MN表示化合物是否具有遗传毒性。

7.一种抗癌候选药物的ADMET性质预测系统,其特征在于,包括:

数据获取模块,其用于获取抗癌候选药物化合物分子描述符信息;

变量筛选模块,其用于对抗癌候选药物化合物分子描述符信息进行多特征提取,筛选出决定ADMET化合物性质的关键特征;

性质预测模块,其用于对筛选出的关键特征进行ADMET性质分类预测,得到抗癌候选药物的ADMET性质预测结果。

8.如权利要求7所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测系统,其特征在于,在所述变量筛选模块中,基于随机森林集成模型对抗癌候选药物化合物分子描述符信息进行多特征提取;

在所述变量筛选模块中,基于抗癌候选药物化合物各个分子描述符与提取的各个特征的之间的相关性,来确定出ADMET化合物性质的关键特征;

在所述性质预测模块中,采用性质预测模型对筛选出的关键特征进行ADMET性质分类预测;其中,所述性质预测模型为支持向量机。

9.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1-6中任一项所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法中的步骤。

10.一种电子设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述程序时实现如权利要求1-6中任一项所述的抗癌候选药物的ADMET性质预测方法中的步骤。

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