[发明专利]一种基于空气中DNA的植物病菌检测方法在审
申请号: | 202210054054.0 | 申请日: | 2022-01-18 |
公开(公告)号: | CN114350844A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 孙晓勇;赵弘巍;张艺迈;李晗 | 申请(专利权)人: | 山东农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 王志坤 |
地址: | 271018 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 空气 dna 植物 病菌 检测 方法 | ||
1.一种基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)在环境中采集样本;(2)在采集的样本中提取空气中的DNA;(3)使用特异性引物检测植物病菌DNA并进行PCR扩增;(4)记录采样的高度,采样时的风速,建立一个植物病菌DNA含量检测模型。
2.根据权利要求1所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,植物病菌包括稻瘟病菌、玉米小斑病菌、水稻纹枯病菌。
3.根据权利要求1所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,步骤(2)中包括过滤气体样品、CTAB法提取DNA。
4.根据权利要求3所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,所述过滤气体样品具体步骤为:将压力过滤器指向样本,收集、过滤指定流速和时间下的稻瘟病菌的气体样品。
5.根据权利要求3所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,所述CTAB法提取DNA具体为:
(a1)用注射器注射3ml的CTAB到压力过滤器中,吸打混匀;
(a2)将步骤(a1)得到的CTAB Buffer平均分装进1.5ml离心管中,每管500ul左右;
(a3)离心管放入水浴锅加热;
(a4)加入500ul苯酚、氯仿和异丙醇的混合溶剂,震荡混合均匀,静止5min;
(a5)离心;
(a6)为增加提取的DNA含量,吸取步骤(a5)中离心后的上清重复步骤(a4)和(a5);
(a7)在新的离心管中加入500ul异丙醇,加入步骤(a6)中的上清,放入-70℃温度下超过1h;
(a8)离心步骤(a7)中的混合液;
(a9)加入1ml的乙醇,震荡后离心;
(a10)倒出乙醇,速离,吸去管内残留的乙醇;
(a11)超净台吹沉淀至透明,加ddH2O,震荡混匀。
6.根据权利要求5所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,步骤(a3)中水浴锅温度为65℃;加热时间为15min。
7.根据权利要求5所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,离心速度均为13000转/分钟;其中步骤(a5)离心时间为10分钟;步骤(a8)离心时间为15min;步骤(a9)离心时间为10分钟。
8.根据权利要求5所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,苯酚:氯仿:异丙醇的体积比为:24:25:1。
9.根据权利要求5所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,步骤(a9)中乙醇的浓度为75%。
10.根据权利要求1所述的基于空气中DNA的植物病菌检测方法,其特征在于,步骤(3)具体为:
(b1)使用特异性引物检测植物病菌DNA;
(b2)扩增条件为95℃作用15min,然后将以下步骤循环40次:95℃作用15s,55℃作用15s,72℃作用50s,72℃持续5min后,12℃进行保持;
(b3)跑胶鉴定PCR结果。
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