[发明专利]一种用于新型冠状病毒Omicron突变株分型的快速检测体系

说明书

本发明公开了一种用于新型冠状病毒Omicron突变株分型的快速检测体系，所述体系中的引物探针是基于双向ARMS PCR技术设计，靶向Omicron突变株的6个突变位点进行检测，对Omicron突变株的检测准确度提高到近100%，最低检测限可低至200copies/mL。具有很好的灵敏性和特异性；可在30分钟内完成整个流程，操作简单、快速、灵敏，对硬件要求低，成本较低，有利于技术制备成试剂盒用于广泛推广。并且将这种检测体系做成冻干形态，进一步提高检测灵敏度。为新型冠状病毒Omicron突变株的快速检测筛查提供有效的技术手段，具有重要意义。

技术领域

本发明属于病毒快速检测试剂领域，具体涉及用于新型冠状病毒Omicron突变株分型的快速检测体系。

背景技术

2021年11月26日，世界卫生组织（World Health Organization，WHO）将奥密克戎（Omicron，B.1.1.529）列为值得关注的新冠变种（Variant of concern，VOC），VOC为最危险变异株，提示它可能具有很高的传播能力或很强的致病性，并且可能降低目前药物和新冠疫苗的有效性。这一变异株受到全球广泛关注。因此，需要迫切了解Omicron的起源和特征，明确现有药物和新冠疫苗对其的保护性，以便为阻断Omicron的传播和治疗该变异株引起的COVID-19提供理论基础。

根据WHO的报告，第一个已知的Omicron感染病例可追溯到2021年11月9日收集的标本，第一个Omicron序列从11月11日在博茨瓦纳收集的标本中获得。南非流行病学数据显示，Beta变异株疫情爆发至100天左右时，测序病例中Beta变异株占每日总测序量的50%左右；在同样的时间周期Delta变异株占每日总测序量的80%左右；而Omicron在爆发后的25天内达到每日总测序量的90%左右。这些数据表明，Omicron变异株可能比Beta和Delta具有更高的传染性。

但是目前，由于这种突变类型是最近被发现，因此市面还没有相关对Omicron分型检测试剂盒的批准。而现有的检测试剂不能做到对Omicron分型检测，甚至可能面对Omicron样本，检测试剂会失效，并由此导致假阴性检测结果。而这对疾病的诊断，防疫政策的成效都可能是极大地挑战。

现有的新冠核酸检测试剂都不能做到对Omicron突变株的快速检测并分型，甚至有可能会对Omicron突变株样本漏检并导致假阴性结果。同时目前所有新冠检测试剂都为液体形态，液体形态在储存，运输及使用过程都极大地延长了单一样本的检测时间。

发明内容

本发明的第一个目的，在于提供一种用于新型冠状病毒Omicron突变株分型检测的引物探针组合。

本发明的第二个目的，在于提供上述引物探针组合在制备新冠病毒新型冠状病毒Omicron突变株分型检测产品中的应用。

本发明的第三个目的，在于提供一种试剂盒。

本发明的第四个目的，在于提供一种新型冠状病毒Omicron突变株分型的检测方法。

本发明的第五个目的，在于提供本发明第一方面所述引物的设计方法。

本发明所采取的技术方案是：

本发明的第一方面，提供用于新型冠状病毒Omicron突变株检测的引物探针组合，包括引物探针组A、引物探针组B和引物探针组C中的至少一种；

所述引物探针组A的序列如下所示：

F1：5'-ACAAACTTGTGCCCTTTTCA-3'；

R1：5'-ACACTTAAAAGTGGAAAATTG-3'；

P1：5'-CGCCACCAGA TTTGCATCTG TTTATG-3'；

所述引物探针组B的序列如下所示：