[发明专利]一种密码子优化的玉足海参海藻糖酶基因及其应用在审
申请号: | 202210074420.9 | 申请日: | 2022-01-21 |
公开(公告)号: | CN114410612A | 公开(公告)日: | 2022-04-29 |
发明(设计)人: | 江晓;任春华;陈廷;胡超群;张鑫;罗鹏;王艳红 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所;南方海洋科学与工程广东省实验室(广州) |
主分类号: | C12N9/24 | 分类号: | C12N9/24;C12N15/81;C12N15/56;C12N1/19;A23K50/80;A23K20/189;C12R1/84 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 朱聪聪;刘明星 |
地址: | 511458 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 密码子 优化 海参 海藻 基因 及其 应用 | ||
1.一种密码子优化的玉足海参海藻糖酶基因,其特征在于,其核苷酸序列是以SEQ IDNO.1所示的序列为基础,作出以下(1)~(69)任意一项或多项的改变:
(1)将第2、17、23、42、45、61、71、84、111、114、122、154、203、264、312、365、427、455、490和517位氨基酸密码子GAT替换为GAC;
(2)将第3、102、130、158、361、371、373、396、397、420、494、496、497、504、510和527位氨基酸密码子GGA替换为GGT;
(3)将第4、43、60、299、310、384、439和493位氨基酸密码子CCT替换为CCA;
(4)将第6、147、207、265、300、425、464、532和535位氨基酸密码子CTT替换为TTG;
(5)将第8、54、80、164、208、360和445位氨基酸密码子GCA替换为GCT;
(6)将第9、121、227、330、354、405、444和511位氨基酸密码子GTA替换为GTT;
(7)将第11、97、327、364和385位氨基酸密码子CTC替换为TTG;
(8)将第13、16、51、58、63、74、123、134、196、202、209、232、253、257、260、269、276、321、358、392、407、413、456、478、484和498位氨基酸密码子GAA替换为GAG;
(9)将第14、26、174、513和516位氨基酸密码子CTG替换为TTG;
(10)将第15、56、67、120、137、230、243、274、340、417和519位氨基酸密码子TAT替换为TAC;
(11)将第18位氨基酸密码子TCT替换为TCC;
(12)将第20、25、219、305和399位氨基酸密码子ACA替换为ACC;
(13)将第21、37、52、64、99、125、132、181、189、197、213、220、255、287、334、383、390、401、505和543位氨基酸密码子TTT替换为TTC;
(14)将第22、53、109、156、272、391、426和539位氨基酸密码子GTG替换为GTT;
(15)将第27位氨基酸密码子AAG替换为AAA;
(16)将第29、185、283、289、315、349、525和547位氨基酸密码子AGT替换为TCC;
(17)将第30、233、341、378和471位氨基酸密码子TCA替换为TCC;
(18)将第32、201、479和492位氨基酸密码子ACG替换为ACT;
(19)将第34、292、319和523位氨基酸密码子CTA替换为TTG;
(20)将第35、108、112、258、297和359位氨基酸密码子GAC替换为GAT;
(21)将第36、38、48、91、270、280、346、380、465和466位氨基酸密码子GCC替换为GCT;
(22)将第44、56、226、236、262、362、370、403、522、526和534位氨基酸密码子ACA替换为ACT;
(23)将第49、82、119、143、229、308、316和512位氨基酸密码子ATA替换为ATC;
(24)将第62、148、160、240和406位氨基酸密码子TTA替换为TTG;
(25)将第68、282、295、296和524位氨基酸密码子GAG替换为GAA;
(26)将第69位氨基酸密码子CCA替换为CCT;
(27)将第70、100、113、140、193、239和508位氨基酸密码子ACT替换为ACC;
(28)将第79和118位氨基酸密码子TTA替换为CTG;
(29)将第81、83、88、110、145、199、249、336、345、404、458和518位氨基酸密码子AAA替换为AAG;
(30)将第85、216、323和387位氨基酸密码子GCA替换为GCC;
(31)将第95、238和450位氨基酸密码子CAT替换为CAC;
(32)将第101和115位氨基酸密码子CTC替换为CTG;
(33)将第103和388位氨基酸密码子AGG替换为AGA;
(34)将第107、242、263和431位氨基酸密码子CAA替换为CAG;
(35)将第117、301、302和530位氨基酸密码子TCG替换为TCC;
(36)将第128、188和422位氨基酸密码子CCC替换为CCA;
(37)将第133位氨基酸密码子CGC替换为AGA;
(38)将第146和419位氨基酸密码子GGG替换为GGT;
(39)将第149位氨基酸密码子CTT替换为CTG;
(40)将第155和306位氨基酸密码子ACG替换为ACC;
(41)将第162、175、241、314、329、374、375、381、395、411、453、463、472、480、489和509位氨基酸密码子AAT替换为AAC;
(42)将第165位氨基酸密码子GCG替换为GCC;
(43)将第166、313、338、533和549位氨基酸密码子TTG替换为CTG;
(44)将第173、191、348、382、421、449和538位氨基酸密码子ATT替换为ATC;
(45)将第176、332、491、506和529位氨基酸密码子GGC替换为GGT;
(46)将第178位氨基酸密码子CGA替换为AGG;
(47)将第179、325和514位氨基酸密码子GTG替换为GTC;
(48)将第186、430和502位氨基酸密码子CAG替换为CAA;
(49)将第194和379位氨基酸密码子GTA替换为GTC;
(50)将第204、256和290位氨基酸密码子CGA替换为AGA;
(51)将第205、278和457位氨基酸密码子GCG替换为GCT;
(52)将第245、337和501位氨基酸密码子GTT替换为GTC;
(53)将第246、259和347位氨基酸密码子CGT替换为AGA;
(54)将第252和440位氨基酸密码子CCG替换为CCA;
(55)将第254、412和454位氨基酸密码子TCA替换为TCT;
(56)将第261、424和469位氨基酸密码子ACC替换为ACT;
(57)将第266、423和428位氨基酸密码子TCG替换为TCT;
(58)将第281、389和546位氨基酸密码子TGC替换为TGT;
(59)将第288位氨基酸密码子TCC替换为TCA;
(60)将第320和357位氨基酸密码子AGT替换为TCT;
(61)将第322和548位氨基酸密码子CGG替换为AGA;
(62)将第344和351位氨基酸密码子GTC替换为GTT;
(63)将第353位氨基酸密码子AGC替换为TCT;
(64)将第418位氨基酸密码子CCC替换为CCT;
(65)将第429位氨基酸密码子GGT替换为GGA;
(66)将第451和536位氨基酸密码子AGC替换为TCC;
(67)将第452位氨基酸密码子ATC替换为ATT;
(68)将第470位氨基酸密码子TCC替换为TCT;
(69)将第556位的终止密码子TGA替换为TAA。
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