[发明专利]影响罗氏沼虾生长性状的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了影响罗氏沼虾生长性状的SNP标记，SNP标记包括UGP2(UTP‑glucos e‑1‑phosphate uridylyltransferase 2)基因上的c.3693 AG位点和c.3672 TC位点。本发明还提供了引物对、试剂盒和应用。利用本发明的SNP标记可进行优势基因型(位点c.3693 AG的AA型和位点c.3672 TC的TT型)个体的筛选，进行罗氏沼虾的分子标记辅助育种，实现生长性状的遗传改良，对培育高产罗氏沼虾新品种(系)具有广阔的应用价值。

技术领域

本发明涉及生物学相关技术领域。更具体地说，本发明涉及2个影响罗氏沼虾生长性状SNP标记及其应用。

背景技术

罗氏沼虾(Macrobruchium rosenbergii)人称“淡水虾王”，在我国淡水养殖业中占据重要的地位。据《2021中国渔业统计年鉴》数据显示，2020年中国罗氏沼虾淡水养殖产量为16.19万吨，较2019年增长了15.96％，涨幅位居四大淡水品种之首。因其具有类似于海虾的鲜嫩口感和味道，以及美如蟹黄般的生殖腺，深受广大消费者欢迎。但近来年出现了种质退化、“铁虾”现象频发，使罗氏沼虾产业面临极大地挑战，严重制约了罗氏沼虾的可持续发展。

分子标记辅助育种在水生生物中得到了广泛的应用，因此挖掘影响罗氏沼虾生长性状的分子标记，建立分子标记辅助育种技术，有效地将常规育种与分子育种结合起来，可对生长性状进行遗传改良，培育罗氏沼虾新品种(系)，进而从根本上解决罗氏沼虾种质退化的难题，推动我国罗氏沼虾产业发展。

发明内容

本发明的一个目的是提供影响罗氏沼虾生长性状的SNP标记及其应用，可利用该SNP标记进行罗氏沼虾的分子标记辅助育种。

为了实现本发明的这些目的和其它优点，根据本发明的一个方面，本发明提供了SNP标记，SNP标记包括UGP2基因上的c.3693AG位点和c.3672TC位点。

进一步地，所述SNP标记与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长、第三腹节宽相关。

根据本发明的另一个方面，还提供了引物对，引物对用于检测所述的SNP标记；用于检测c.3693AG位点的所述引物对具有SEQIDNO:1～2所示的核苷酸序列；用于检测c.3672TC位点的所述引物对具有SEQIDNO:3～4所示的核苷酸序列。

根据本发明的另一个方面，还提供了用于检测SNP标记的试剂盒，包括所述的引物对。

根据本发明的另一个方面，还提供了SNP标记的用途，用于筛选不同生长性状的罗氏沼虾。

根据本发明的另一个方面，还提供了SNP标记的用途，用于罗氏沼虾的分子标记辅助育种。

本发明至少包括以下有益效果：

本发明提供了UGP2基因上的c.3693AG位点和c.3672TC位点，该两个位点与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长、第三腹节宽相关，使得该两个位点可以为筛选、培育罗氏沼虾新品种(系)提供参考。

本发明的其它优点、目标和特征将部分通过下面的说明体现，部分还将通过对本发明的研究和实践而为本领域的技术人员所理解。

具体实施方式

下面结合实施例对本发明做进一步的详细说明，以令本领域技术人员参照说明书文字能够据以实施。

应当理解，本文所使用的诸如“具有”、“包含”以及“包括”术语并不排除一个或多个其它元件或其组合的存在或添加。

本申请的实施例提供了SNP标记，SNP标记包括UGP2(UTP-glucose-1-phosphateuridylyltransferase2)基因上的c.3693AG位点和c.3672TC位点；AG和TC表示碱基的转换。