[发明专利]一种可重复使用的测序方法在审
申请号: | 202210103650.3 | 申请日: | 2022-01-28 |
公开(公告)号: | CN116555408A | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
发明(设计)人: | 石磊;刘海涛;乔朔;宋豫京 | 申请(专利权)人: | 赛纳生物科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6874 | 分类号: | C12Q1/6874;C12Q1/6844;G01N33/68;G01N33/53 |
代理公司: | 北京嘉途睿知识产权代理事务所(普通合伙) 11793 | 代理人: | 李鹏 |
地址: | 100176 北京市大兴*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 重复使用 方法 | ||
1.一种可重复使用的测序方法,其特征在于,包括:
提供包括表面的基因测序芯片,所述芯片的表面沉积有可降解水凝胶微颗粒点群;所述水凝胶微颗粒连接待测基因片段;
提供测序反应液对待测基因片段进行测序;
降解水凝胶微颗粒并使其从芯片表面脱离;
再次在所述芯片的表面形成更新的可降解水凝胶微颗粒点群,所述更新的可降解水凝胶微颗粒点群连接有更新的待测基因片段;
通入测序反应液对更新的待测基因片段进行测序。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述水凝胶微颗粒点群或者更新的水凝胶微颗粒点群,是水凝胶形成的独立的用于测序的,有序排列,或者无序排列的微单元群;所述水凝胶微颗粒点群为水凝胶微球的点群或水凝胶微区域的点群中的一种。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述水凝胶微颗粒的大小为0.2-5微米,优选0.3-3微米,更优选0.35-2.5微米。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因测序芯片至少一侧的表面有预先加工好的阵列的或非阵列的微反应室,所述可降解水凝胶微颗粒分布于所述微反应室内部区域。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因测序芯片的表面没有微反应室;所述沉积水凝胶的方法为在芯片表面通过纳米压印的方法形成阵列的化合物修饰点,再通过此修饰点上的化合物,进行水凝胶的聚合反应,从而形成以阵列的化合物修饰点为基础的水凝胶微颗粒。
6.根据权利要求1-5任一项所述的方法,其特征在于,所述水凝胶包括丙烯酰胺、N,N'-双(丙烯酰)胱胺。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述降解水凝胶微颗粒的方法包括加入还原剂,所述还原剂是膦化合物、水溶性膦、含氮膦及其盐和衍生物、二硫赤藓糖醇、二硫苏糖醇、2-巯基乙醇或氨基乙硫醇、谷胱甘肽、巯基乙酸或巯基乙酸、2,3-二巯基丙醇、三(2-羧基乙基)膦、三(羟基甲基)膦或对-[三(羟甲基)膦]丙酸,或前述两种物质或多种物质的组合。
8.一种可重复使用的检测方法,其特征在于,包括:
提供可降解水凝胶颗粒,所述水凝胶颗粒表面附接待检测物质,且修饰有第一官能团;
提供生物化学芯片,所述芯片的内表面预先修饰第二官能团;
通入含有水凝胶颗粒的溶液;通过第一官能团和第二官能团的反应,将水凝胶颗粒固定到芯片的内表面;
通入反应液进行生物化学反应;
将水凝胶颗粒降解并去除;
重新通入含有水凝胶颗粒的溶液,将水凝胶颗粒再次固定到芯片的内表面;通入反应液对更新的待检测物质进行检测。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述生物化学反应指的是涉及核酸和/或蛋白质的反应,包括扩增反应,测序反应,核酸-蛋白质相互作用、蛋白质-蛋白质相互作用中的一种。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述第一官能团和第二官能团包括:生物素,链霉亲和素,羧基,氨基,硅羟基,叠氮基团,炔基,环炔基,环氧乙基等。
11.根据权利要求8-10任一项所述的方法,其特征在于,所述水凝胶包括丙烯酰胺、N,N'-双(丙烯酰)胱胺;所述降解水凝胶颗粒的方法包括加入还原剂,所述还原剂是膦化合物、水溶性膦、含氮膦及其盐和衍生物、二硫赤藓糖醇、二硫苏糖醇、2-巯基乙醇或氨基乙硫醇、谷胱甘肽、巯基乙酸或巯基乙酸、2,3-二巯基丙醇、三(2-羧基乙基)膦、三(羟基甲基)膦或对-[三(羟甲基)膦]丙酸,或前述两种物质或多种物质的组合。
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