[发明专利]芯片、应用及制备芯片的方法在审
申请号: | 202210121857.3 | 申请日: | 2022-02-09 |
公开(公告)号: | CN116606725A | 公开(公告)日: | 2023-08-18 |
发明(设计)人: | 刘思雨;刘磊;周利芳;林志峰;李广;陈方;孙雷 | 申请(专利权)人: | 深圳市真迈生物科技有限公司 |
主分类号: | C12M1/34 | 分类号: | C12M1/34;C12M1/00;B01L3/00;C12Q1/6874 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 邵泳城 |
地址: | 518023 广东省深圳市罗湖区清水河街道清水河社区清*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 芯片 应用 制备 方法 | ||
本申请公开了芯片、应用及制备芯片的方法。该芯片包括第一基板和第二基板,第二基板与第一基板层叠设置,第二基板包括相背的第一表面和第二表面,其中第二基板的第一表面朝向第一基板,第二基板的第一表面与第一基板之间设有一个或多个流体通道;该芯片还包括设置在第二基板的第二表面上的第一涂层,第一涂层具有的自发荧光强度小于预设强度;所述流体通道内形成有第二涂层。该芯片第二基板的第二表面上设有特定的第一涂层,该第一涂层具有较弱的自发荧光特性。该芯片特别适用于基于光学系统对芯片进行成像以检测芯片内的生物分子的平台。另外,芯片中的第二涂层可以减少空气中杂质吸附在流体通道内,减少芯片的测序错误率。
技术领域
本申请涉及核酸检测领域,尤其涉及一种芯片、应用及制备芯片的方法。
背景技术
本部分中讨论的主题不应仅因为在本部分中有提及就被认为是现有技术。类似地,在本部分中提及的或与作为背景技术提供的主题相关联的技术问题不应被认为先前在现有技术中已被认识到。本部分中的主题仅表示不同的方法,这些方法本身也可对应于权利要求书的技术方案的具体实施方式。
适配于测序平台的芯片,是可承载待测核酸、能够容纳溶液为待测核酸提供反应环境或检测环境的反应装置,也称为流动小室或流动池(flow-cell)。
可利用粘合剂将两片玻璃(两片玻璃的相对的两个表面中的至少一个表面经过蚀刻处理)和一块不透光的基板进行粘合封装以制成内部有空间/腔室/通道的芯片。
在基于光学成像系统检测芯片实现测序的平台(有时简称为测序仪)上,通过对芯片指定位置(连接有待测核酸分子的表面,有时也称为视野/反应区域)进行成像、进而基于该些图像的信息识别和确定待测核酸分子的碱基排列次序。例如,具体地,在利用带有荧光标记的核苷酸、基于边合成边测序原理进行测序的平台,在测序中,测序仪中的激光器发出的高能激光通过镜头照射到芯片的反应区域,反应区域中的待测核酸分子置于试剂溶液中,激光对试剂溶液中的荧光分子进行照射并激发其发出荧光信号,进而采集该些荧光信号例如拍照以获得图像,基于该些图像上的信息识别和确定碱基排列次序以达成测序目的。
上述测序平台基于光学系统对芯片进行成像、基于图像来实现检测,可以理解地,图像具有越高的信噪比,测序结果就越准确可靠。而成像对象即待测核酸分子例如单分子或分子簇位于芯片指定表面,可以理解地,在芯片的制备、存放、运输和/或使用的过程中,任何可能影响或改变表面特性或者其上的待测分子的行为,都会影响采集得的图像的信号,进而影响基于图像信息的分子检测。例如:芯片制备、保存存放过程中,空气中或者预期外的情景中的物质可能非特异性吸附于芯片通道内或指定表面上。在基于芯片成像实现测序的平台中,这种非特异性吸附引入的预期外的物质会影响测序生化和/或成像,例如导致拍摄的图像的信噪比降低,从而使得基于该些图像信息的碱基识别的错误率升高或者高质量测序数据减少。
另外,芯片的指定表面一般是经过化学修饰的、带有反应位点的表面,反应位点有时也称为(活性)官能团;在芯片的制备和存放过程中,吸附于官能团的期望外的物质相当于占据了一部分官能团/反应位点,如此,减少了该表面可用的官能团,降低了该表面的负载量、降低了检测通量。同时,芯片指定表面上的官能团或其聚合物通常容易与空气中的氧气、水分等发生氧化或水解反应,导致聚合物降解,这样很可能会进一步引入噪音,增加测序数据的错误率。
发明内容
本申请实施方式提供一种芯片、应用及制备芯片的方法。
本申请实施方式的芯片包括第一基板;与所述第一基板层叠设置的第二基板,所述第二基板包括相背的第一表面和第二表面,所述第二基板的第一表面朝向所述第一基板,所述第二基板的第一表面和所述第一基板之间设有一个或多个流体通道;所述第二基板的第二表面上设置第一涂层,所述第一涂层的自发荧光强度小于预设强度;所述流体通道内形成有第二涂层。
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