[发明专利]基于SNP位点的基因身高预测试剂盒和芯片及方法在审
申请号: | 202210160046.4 | 申请日: | 2022-02-22 |
公开(公告)号: | CN114317706A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
发明(设计)人: | 陈燕君;肖姗姗;王涛 | 申请(专利权)人: | 杭州瑞普基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876;C12N15/11;G16B20/20;G16B20/30;G16B25/20;G16B40/00;G16B50/30 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 吴婷 |
地址: | 311100 浙江省杭州市余杭区*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 snp 基因 身高 预测 试剂盒 芯片 方法 | ||
1.一种用于预测身高的SNP,其特征在于,包括下列的至少之一:rs10946808、rs10958476、rs11021504、rs11205277、rs11765954、rs12198986、rs12338076、rs1351394、rs143383、rs143384、rs1776897、rs1812175、rs185819、rs2282978、rs3130050、rs3748069、rs3751599、rs3760318、rs3791675、rs3791679、rs3816804、rs3823418、rs4533267、rs4713858、rs4743034、rs4794665、rs4800148、rs4821083、rs6030712、rs6060369、rs6763931、rs678962、rs6830062、rs7153027、rs7571816、rs757608、rs7678436、rs7846385、rs7968682、rs798544、rs8756和rs967417。
2.一种用于检测权利要求1所述的SNP的探针,其特征在于,所述探针具有如SEQ IDNO:1~42任一所述核苷酸序列。
3.一种用于预测身高的试剂盒或芯片,其特征在于,包括权利要求2所述用于检测权利要求1所述的SNP的探针。
4.检测权利要求1所述用于预测身高的SNP的试剂、权利要求2所述用于检测所述的SNP的探针或者权利要求3所述用于预测身高的试剂盒或芯片在构建预测身高的机器学习模型或者预测身高中的应用。
5.一种构建用于预测身高的机器学习模型的方法,其特征在于,包括:
获取已知性别和身高值的受试者的生物样本;
提取所述生物样本的基因组DNA;
测定所述基因组DNA中如权利要求1所述用于预测身高的SNP的基因型;
以所述SNP的基因型作为机器学习模型的输入特征,以性别和身高值作为标记,进行训练,获得用于预测身高的机器学习模型。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,利用权利要求2所述用于检测SNP的探针识别所述基因组DNA上的所述SNP;
任选地,所述生物样本选自外周血、唾液、试子和/或实体组织;
任选地,所述机器学习模型为回归模型。
7.一种预测身高的方法,其特征在于,包括:
获取已知性别受试者的生物样本;
提取所述生物样本的基因组DNA;
测定所述基因组DNA中如权利要求1所述用于预测身高的SNP的基因型;
将性别和所述SNP的基因型输入预先构建的机器学习模型中,进行测试,以便预测所述受试者的身高值。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述预先构建的机器学习模型是通过权利要求5或6所述构建用于预测身高的机器学习模型的方法获得的。
9.一种可执行的存储介质,其特征在于,所述存储介质存储有计算机程序指令,所述计算机程序指令在处理器上运行时,使所述处理器执行如权利要求7或8所述预测身高的方法。
10.一种电子设备,其特征在于,包括:
权利要求9所述可执行的存储介质;
所述处理器,用于执行所述计算机程序以实现如权利要求7或8所述预测身高的方法。
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