[发明专利]食管癌的生物标志物、核酸产品和试剂盒

说明书

本发明涉及一种食管癌的生物标志物、核酸产品和试剂盒。该食管癌的生物标志物为HOXD1基因和GSX1基因中的至少一种，通过检测该生物标志物的甲基化水平诊断食管癌。上述食管癌的生物标志物在应用过程中具有较高的灵敏度，可以提高食管癌的检出率，提高检测准确性，有助于实现人群分流，提升内镜检查的依从性，有利于提升食管癌特别是早期食管癌的早诊率。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种食管癌的生物标志物、核酸产品和试剂盒。

背景技术

根据GLOBOCAN 2020的最新统计数据，食管癌是全球发病率第十的恶性肿瘤，其死亡率位居第六。尽管在一些研究中观察到食管癌患者的生存率增加，但有其他癌症相比，食管鳞癌/食管癌的预后相对较差，大多数研究显示食管癌患者的5年生存率在15％～25％之间。在一项包括1033名接受手术的ESCC患者的人群研究中，IA、IB、IIA、IIB、IIIA、IIIB、IIIC和IV期患者的5年生存率分别为84.9％、70.9％、56.2％、43.3％、37.9％、23.3％、12.9％和3.4％(Wang J,Wu N,Zheng QF,Yan S,Lv C,Li SL,et al.Evaluation of the7th edition of the TNM classification in patients with resected esophagealsquamous cell carcinoma. World J Gastroenterol.(2014)20:18397–403.doi:10.3748/wjg.v20.i48.1839)。另外，首次诊断时有远处器官转移的食管癌患者的生存率特别差，一项回顾性研究表明，这些患者的中位生存期仅为6个月，1年或2年生存率分别为21.1％或 11.8％(Chen MQ,Xu BH,Zhang YY.Analysis of prognostic factors foresophageal squamous cell carcinoma with distant organ metastasis at initialdiagnosis.J Chin Med Assoc.(2014)77:562–6.doi:10.1016/j.jcma.2014.05.014)，这些证据均表明，食管癌的早诊早治可提升食管癌患者的生存率。

目前，内镜及病理活检是诊断早期食管癌的金标准。内镜下可直观地观察食管黏膜改变，评估癌肿状态，拍摄或录制病变影像资料，并可通过染色、放大等方法评估病灶性质、部位、边界和范围，一步到位地完成筛查和早期诊断。然而，内镜检测依赖于医院硬件设备和医生经验，并且具有侵入性、患者依从性低等缺点，另外内镜的筛查量远远低于中国食管癌高发区人群的筛查需求。另外，虽然有利用肿瘤标志物诊断食管癌的试剂盒，但这些试剂盒的灵敏度还有待提高。

发明内容

基于此，有必要提供一种食管癌的生物标志物，通过检测该生物标志物的甲基化水平来诊断食管癌，可以改善传统生物标志物对食管癌检测灵敏度低的问题。

此外，还提供一种上述生物标志物在制备用于诊断食管癌的试剂或试剂盒中的应用、诊断食管癌的核酸产品和试剂盒。

一种食管癌的生物标志物，所述生物标志物为HOXD1基因和GSX1基因中的至少一种，通过检测所述生物标志物的甲基化水平诊断食管癌。

经本发明研究发现，以HOXD1基因和GSX1基因中的至少一种作为生物标志物，通过检测HOXD1基因和GSX1基因中的至少一种的甲基化水平来诊断或辅助诊断食管癌，具有较高的灵敏度，可以有效地提高食管癌的检出率，进而提高检测准确度。

上述生物标志物在制备用于诊断食管癌的试剂或试剂盒中的应用。

一种核酸产品，包括用于检测HOXD1基因和/或GSX1基因的甲基化水平的检测引物对。

在其中一个实施例中，所述核酸产品包括用于检测 Chr2:176189800～176189943区域和/或Chr13:27793590～27793770区域的甲基化水平的检测引物对。