[发明专利]一种水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测引物组、试剂盒和检测方法在审
申请号: | 202210184285.3 | 申请日: | 2022-02-23 |
公开(公告)号: | CN114317835A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
发明(设计)人: | 戴银;李梅珍;殷冬冬;尹磊;王洁茹;胡晓苗;赵瑞宏;沈学怀;潘孝成;周学利;侯宏艳;张朝霞 | 申请(专利权)人: | 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 合肥东邦滋原专利代理事务所(普通合伙) 34155 | 代理人: | 王天马 |
地址: | 230000 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 水禽 细小 病毒 肠炎 星状 多重 pcr 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测引物组,其特征在于,所述多重PCR检测引物组包括以下三组:
(1)用于检测水禽细小病毒的引物组,由GPV-MDPV-F和GPV-MDPV-R组成的引物组,其中:
GPV-MDPV-F的核苷酸序列为:
5’-TGGAAGAAGGCAGTGAGT-3’;
GPV-MDPV-R的核苷酸序列为:
5’-AGGTCCGTAGAGCCATAT-3’;
(2)用于检测鸭肠炎病毒的引物组,由DEV-F和DEV-R组成的引物组,其中:
DEV-F的核苷酸序列为:
5’-CCAAGATACCAGTGATGC-3’;
DEV-R的核苷酸序列为:
5’-ACCTACAATTCAGCAACG-3’;
(3)用于检测鹅星状病毒的引物组,由GAstV-F和GAstV-R组成的引物组,其中:
GAstV-F的核苷酸序列为:
5’-TCATTACGAGCAGGAGAA-3’;
GAstV-R的核苷酸序列为:
5’-CTGCACCGCAACTTTAAA-3’。
2.根据权利要求1所述的水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测引物组,其特征在于,所述用于检测水禽细小病毒的引物组,其检测靶标基因为Rep1基因,引物大小为746bp。
3.根据权利要求1所述的水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测引物组,其特征在于,所述用于检测鸭肠炎病毒的引物组,其检测靶标基因为UL54基因,引物大小为641bp。
4.根据权利要求1所述的水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测引物组,其特征在于,所述用于检测鹅星状病毒的引物组,其检测靶标基因为ORF1a基因,引物大小为460bp。
5.一种根据权利要求1-4任一项所述的水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、质粒标准品的制备及提取
S11、取GPV和MDPV毒株、DEV毒株、GAstV毒株,按照DNA/RNA提取试剂盒说明书提取核酸,RNA样品按试剂盒说明书逆转录合成cDNA第一链备用,利用设计的三组引物,进行PCR扩增;
S12、回收、纯化PCR产物,并连接至pUC57载体,转化后构建pUC-GPV-MDPV、pUC-DEV、pUC-GAstV共三种重组质粒,并将重组质粒菌液送至生工生物工程(南京)股份有限公司测序鉴定;
S13、按照质粒提取试剂盒说明书提取质粒DNA,采用核酸浓度测定仪测定质粒DNA浓度;
S2、多重PCR方法的建立
S21、多重PCR反应体系:Premix TaqTM 10μL,上游引物(20μM)1μL,下游引物(20μM)1μL,DNA模板0.5μL,ddH2O补充至20μL;设置退火温度分别为48℃、49.2℃、51.8℃、53.2℃、56.2℃、58.8℃、60℃;设置GPV-MDPV、GAstV、DEV引物浓度比分别为1:4:5、3:2:3、5:1:1、2:4:5、4:5:2;
S22、通过优化,筛选出多重PCR最适反应条件,其中退火温度为56.2℃;GPV-MDPV、GAstV、DEV引物(20μM)体积比为1:4:5;反应体系为Premix TaqTM 10μL,每种病毒模板0.5μL,ddH2O补至20μL。最佳扩增条件:94℃预变性5min;94℃变性30s,56.2℃退火30s,72℃延伸90s,共35个循环;72℃终延伸10min。
6.一种根据权利要求5所述的水禽细小病毒、鸭肠炎病毒及鹅星状病毒的多重PCR检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括质粒标准品、三组多重PCR检测引物组、PCR试剂及多重PCR反应体系和最适反应条件。
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