[发明专利]一种基于全局信息融合的多模态医学图像融合方法在审
申请号: | 202210202366.1 | 申请日: | 2022-03-03 |
公开(公告)号: | CN114565816A | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
发明(设计)人: | 陈勋;张静;刘爱萍;张勇东;吴枫 | 申请(专利权)人: | 中国科学技术大学 |
主分类号: | G06V10/80 | 分类号: | G06V10/80;G06V10/82;G06V10/774;G06N3/04;G06N3/08;G06K9/62 |
代理公司: | 安徽省合肥新安专利代理有限责任公司 34101 | 代理人: | 陆丽莉;何梅生 |
地址: | 230026 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 全局 信息 融合 多模态 医学 图像 方法 | ||
1.一种基于全局信息融合的多模态医学图像融合方法,其特征包括如下步骤:
步骤一、获取M个不同模态的原始医学图像并进行YCbCr色彩空间的转换,得到所有模态的Y通道图像{I1,…,Im…,IM};其中,Im表示第m个模态的Y通道图像,m∈{1,2,…,M};对所有模态的Y通道图像{I1,…,Im…,IM}进行图像剪切,从而得到所有模态的图像块集合{S1,…,Sm…,SM},其中,Sm表示第m个模态的图像块集合;
步骤二、构建融合网络TransFusion,包括:M个模态分支网络、N个融合模块、一个重构模块;并将所有模态的图像块集合{S1,…,Sm…,SM}输入所述融合网络TransFusion中:
步骤2.1、构建所述M个模态分支网络和N个融合模块:
步骤2.1.1、构建M个模态分支网络:
M个模态分支网络中的第m个模态分支网络由N个卷积模块组成,并将N个卷积模块分别记为ConvBlockm1,…,COnvBlockmn,…,ConvBlockmN,其中,ConvBlockmn表示第m个模态分支网络的第n个卷积模块,n∈{1,2,…,N};
当n=1时,所述第m个模态分支网络的第n个卷积模块ConvBlockmn由Xmn个二维卷积层组成;
当n=2,3,…,N时,所述第m个模态分支网络的第n个卷积模块ConvBlockmn由一个最大池化层和Xmn个二维卷积层组成;
第m个模态分支网络的第n个卷积模块的第x个二维卷积层的卷积核尺寸为ksmnx×ksmnx,卷积核数目为knmnx,x∈{1,2,…,Xmn};
步骤2.1.2、构建N个融合模块:
N个融合模块的任意第n个融合模块为一个Transformer网络,并由L个自注意力机制模块构成;L个自注意力机制模块中的第l个自注意力机制模块包括:1个多头注意力层、2个层归一化、1个全连接层;
步骤2.2、将所有模态的图像块集合{S1,…,Sm…,SM}输入M个模态分支网络中,并通过N个融合模块进行信息融合:
当n=1时,所述第m个模态的图像块集合Sm输入所述第m个模态分支网络的第n个卷积模块ConvBlockmn的Xmn个二维卷积层后输出特征图其中,Hn、Wn、Dn分别表示第m个模态分支网络在第n个卷积模块的输出特征图的高、宽、通道数;从而得到M个模态分支网络在第n个卷积模块的输出特征图
将所述M个模态分支网络在第n个卷积模块的输出特征图经过第n个融合模块处理后,输出特征图其中,表示第n个融合模块输出的第m个特征图;
将所述第n个融合模块输出的第m个特征图与所述第m个模态分支网络的第n个卷积模块输出的特征图进行相加,得到第m个模态分支网络在第n个卷积模块交互后的特征图从而得到M个模态分支网络在第n个卷积模块交互后的特征图当n=2,3,…,N时,将第m个模态分支网络在第n-1个卷积模块交互后的特征图输入到第m个模态分支网络的第n个卷积模块的最大池化层中进行下采样处理,得到第m个模态分支网络在第n个卷积模块下采样后的特征图将所述下采样后的特征图输入第m个模态分支网络的第n个卷积模块的第1个二维卷积层中,并依次经过Xmn个二维卷积层的处理后,输出特征图从而得到M个模态分支网络的第n个卷积模块输出的特征图将所述特征图经过第n个融合模块的处理后,输出特征图将第n个融合模块输出的第m个特征图与第m个模态分支网络的第n个卷积模块输出的特征图进行相加,得到相加后的特征图从而得到M个相加后的特征图进而得到第N个融合模块输出的特征图
步骤2.3、所述重构模块由N级卷积网络构成;并将N个融合模块输出的特征图输入到所述重构模块,得到初步融合图像F′:
步骤2.3.1、将所述第n个融合模块输出的所有特征图进行相加,得到融合特征图Φn;从而得到N个融合模块的融合特征图{Φ1,…,Φn,…,ΦN};
步骤2.3.2、构建由N级卷积网络构成的重构模块,并将第n个融合模块的融合特征图Φn输入到重构模块的第n级卷积网络:
当n=1时,第n级卷积网络包括:Bn个卷积模块
当n=2,3,…,N时,第n级卷积网络包括:Bn个卷积模块和Bn+1个上采样层第n级卷积网络的第b个卷积模块RConvBlocknb由Y个二维卷积层组成,b∈{1,2,…,Bn};
当n=1且b=1时,将所述第n个融合模块的融合特征图Φn输入到所述第n级卷积网络的第b个卷积模块RConvBlocknb,并输出特征图ΦRnb;
当n=2,3,…,N且b=1时,将所述第n个融合模块的融合特征图Φn输入到第n级卷积网络的第b个上采样层UpSamplenb中进行上采样处理后,输出上采样的特征图ΦUnb;从而得到第2级到第N-1级卷积网络的上采样后的特征图{ΦU2b,…,ΦUnb,…,ΦUNb};
当n=2,3,…,N且b=2,3,…,Bn时,将第n个融合模块的融合特征图Φn、第n级卷积网络的前b-1个卷积模块的输出特征图{ΦRn1,…,ΦRn(b-1)}、第n+1级卷积网络的前b个上采样后的特征图{ΦU(n+1)1,…,ΦU(n+1)b}进行拼接后,得到拼接后的特征图;将所述拼接后的特征图输入到第n级卷积网络的第b个卷积模块RConvBlocknb,并输出第n级卷积网络的第b个卷积模块的输出特征图ΦRnb;从而得到第1级卷积网络的第B1个卷积模块的输出特征图
将所述第1级卷积网络的第B1个卷积模块的输出特征图经过一个卷积层的处理后,获得初步融合图像F′;
步骤三、构建损失函数并训练网络得到最优融合模型:
步骤3.1、分别计算所有模态的图像块集合{S1,…,Sm…,SM}中各个图像块集合的熵,并得到相应的熵值{e1,…,em…,eM},其中,em表示第m个模态的图像块集合的熵值;
步骤3.2、对所述熵值{e1,…,em…,eM}分别进行归一化处理后,得到所有模态的图像块集合{S1,…,Sm…,SM}的权重{ω1,…,ωm,…,ωM},其中,ωm表示第m个模态的图像块集合的权重;
步骤3.3、利用式(1)构建总损失函数Loss:
式(1)中,Lssim(Sm,F′)表示所述第m个模态的图像块集合Sm与所述初步融合图像F′之间的结构相似性损失函数;
步骤3.4、利用优化器对所述总损失函数Loss进行最小化求解,从而对融合网络TransFusion中的所有参数进行优化,并得到最优融合模型;
步骤四、利用最优融合模型对所有模态的Y通道图像{I1,I2,…,IM}进行处理并输出初步融合图像F′;将初步融合图像F′转换到RGB色彩空间,从而得到最终融合图像F。
2.根据权利要求1所述的基于全局信息融合的多模态医学图像融合方法,其特征是,所述步骤2.2中的第n个融合模块按以下过程进行处理:
步骤2.2.1、第n个融合模块对所述M个模态分支网络在第n个卷积模块输出的特征图进行拼接并拉平,得到尺寸为(M*Hn*Wn)×Dn的拉平后的特征向量;再将所述拉平后的特征向量与一个相同尺寸的可训练向量进行相加,得到第n个融合模块的包含位置信息的特征向量
步骤2.2.2、当l=1时,第n个融合模块的第l个自注意力机制模块将所述特征向量进行线性映射后,得到三个矩阵Qnl,Knl,Vnl;再计算Qnl,Knl,Vnl之间的多头注意力结果Znl;所述多头注意力结果Znl输入到第n个融合模块的第l个自注意力机制模块的全连接层中,并得到第n个融合模块的第l个自注意力机制模块的输出序列向量
当l=2,3,…,N时,将第n个融合模块的第l-1个自注意力机制模块的输出序列向量输入第n个融合模块的第l个自注意力机制模块中,并得到第n个融合模块的第l个自注意力机制模块的输出序列向量从而得到第n个融合模块的第L个自注意力机制模块的输出序列向量
步骤2.2.3、将所述输出序列向量划分成M个模态,然后将每个模态的尺寸变形为Hn×Wn×Dn,以得到输出特征图
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