[发明专利]一种水稻稻瘟病抗性基因Pita的dCAPS分子标记及应用

说明书

本发明公开水稻稻瘟病抗性基因Pita的dCAPS分子标记机应用，稻瘟病抗性基因Pita功能特异性分子标记为Pita‑dCAPS；所述Pita‑dCAPS分子标记利用引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从携带有稻瘟病抗性基因Pita的水稻品种的基因组DNA中扩增出来，并且可以被内切酶Ecop151特异性识别，而不含有抗性基因Pita水稻品种的基因组DNA不能被内切酶Ecop151识别；其中，SEQ ID NO.1：5’‑ATCACGGGTATGGATTTTTCA‑3’；SEQ ID NO.2：5’‑GTGCATCTTCAACCTGACTTGATGATTGTTTGA‑3’；本发明获得的稻瘟病抗性基因Pita的dCAPS分子标记能够应用于鉴别水稻品种中稻瘟病抗性基因Pita。

技术领域

本发明涉及农业生物技术领域，具体涉及一种水稻稻瘟病抗性基因Pita的dCAPS分子标记及应用。

背景技术

水稻是世界主要粮食作物之一，全世界有超过50％以上的人口以水稻为主要粮食，预计到2030年，水稻年产量要在现有基础上，再增产40％才能满足全世界人们的消费需求。稻瘟病是水稻最重要的病害之一，给我国甚至全世界粮食安全生产带来了巨大的隐患。在中国，几乎每年都有不同水稻产区发生中等以上稻瘟病病害，在过去20年中，稻瘟病病害还有不断增长的趋势。稻瘟病可以引起水稻大幅度减产，严重时减产40％～50％，甚至颗粒无收。但由于稻瘟病生理小种致病性变异快，单一抗性品种的抗性会逐渐丧失；而传统的抗病育种策略存在工作量大，周期长等特点。因此，迫切需要改变传统抗病育种的策略。

利用R基因进行的抗性育种改良是田间作物管控病害的一种经济高效，且环保的方式。在水稻的抗性育种中，过去利用诸如系谱法等常规方法培育一个新品种往往要耗费长达10-15年的时间，且其过程依赖抗病表型鉴定，结果易受周围环境和人为因素的干扰，从而降低了抗性品种的选择效率。分子标记在育种中的一个主要应用——MAS，是通过对与R基因紧密连锁或基因内开发的分子标记进行基因分型，来间接筛选目标性状的一项技术。它由于不受其他基因效应和环境条件的影响，且允许在早代进行大范围、高强度的选择，故能大大提高常规回交转育的准确性，缩短育种年限，同时实现多个基因的精确累加。随着水稻基因组测序工作的完成，以及分子标记和生物技术的不断开发应用，MAS已然成为现代分子设计育种的一个重要手段。

20世纪60年代，日本率先开展稻瘟病抗性基因分析研究，在最初的8个抗性位点中鉴定出14个基因，建立了一套稻瘟病抗性基因分析鉴定体系。近几十年来，随着水稻抗稻瘟病分子遗传学的发展，国际水稻研究所等水稻生产国和我国也逐步开展了水稻抗稻瘟病基因的系统研究，精细定位或大量抗病基因克隆，而分子标记的发展和应用极大地促进了抗性遗传背景的鉴定和育种的发展。因此，直接分析功能等位基因序列并开发其功能特异的分子标记来选择目标基因，不仅具有较高的选择可靠性，而且大大加快育种步伐。

稻瘟病抗性基因Pita，对日本很多稻瘟病菌小种有抗性，而且对于中国的菌株KJ201和FJ2011能够表现出较强的抗病反应，因此，为了能更准确有效地将稻瘟病广谱抗性基因Pita应用到水稻抗性育种工作中，有必要开发真实反映Pita基因且方便易用dCAPS分子标记。

发明内容

本发明提供稻瘟病抗性基因Pita的dCAPS分子标记与应用，开发真实反映稻瘟病广谱抗性基因Pita，方便易用且具有较高准确性和稳定性的Pita的dCAPS分子标记，使得稻瘟病广谱抗性基因Pita更好的应用到水稻抗性育种中。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：

本发明提供一种水稻稻瘟病抗性基因Pita的dCAPS分子标记，稻瘟病抗性基因Pita功能特异性分子标记为Pita-dCAPS；所述Pita-dCAPS分子标记利用引物对SEQ IDNO.1和SEQ ID NO.2从携带有稻瘟病抗性基因Pita的水稻品种的基因组DNA中扩增出来。

SEQ ID NO.1：5’-ATCACGGGTATGGATTTTTCA-3’；