[发明专利]一种用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR分子标记及其应用。本发明还公开了用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR引物组，其由引物对1‑引物对29组成。所述SSR引物组具有如下n1)‑n5)任一种功能：n1)分析或评价槭叶铁线莲遗传多样性；n2)分析或评价槭叶铁线莲遗传分化程度；n3)分析或评价槭叶铁线莲遗传亲缘关系；n4)构建或制备槭叶铁线莲遗传图谱或指纹图谱；n5)鉴定或区分不同地理种群槭叶铁线莲。本发明利用简化基因组的测序结果进行拼接，筛选出适宜槭叶铁线莲遗传多样性研究的SSR分子标记，对开展槭叶铁线莲遗传多样性研究和保育工作具有重要意义。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR分子标记及其应用。

背景技术

槭叶铁线莲(Clematis acerifolia Maxim.)是毛茛科，铁线莲属植物。花期四月，花姿优雅，主要分布在北京地区的房山、门头沟等地，在河北、河南偶有分布。由于气候变化、经济开发及其自身遗传特性的变化，槭叶铁线莲种群呈现出植物数量较少、分布狭窄、种群自我更新和繁殖较慢的问题，属于北京市一级保护植物。

遗传多样性是指种群内部及种群间遗传变异的总和。遗传多样性反映了植物对不良环境的抵抗能力。通过遗传多样性评价，可以了解植物的现状，预测植物发展的未来，对保护珍稀植物具有重要作用。进行植物遗传多样性评价可以使用表型标记、生化标记和分子标记。SSR(Simple Sequence Repeats)标记数量丰富、覆盖整个基因组，具有极其丰富的多态性和共显性特点，在遗传多样性研究中应用广泛。

为保护槭叶铁线莲，评估其种群状态，判断其种群发展趋势，对槭叶铁线莲保护提出切实可行的策略，研究其遗传多样性有重要意义。由于槭叶铁线莲尚无基因组测序相关信息，因此开发其相关的SSR分子标记具有一定难度。

发明内容

本发明的目的是提供用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR分子标记及其应用。

为了实现上述目的，本发明首先提供了可用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR引物组。

本发明提供的可用于槭叶铁线莲遗传多样性分析的SSR引物组包括引物对1、引物对2、引物对3、引物对4、引物对5、引物对6、引物对7、引物对8、引物对9、引物对10、引物对11、引物对12、引物对13、引物对14、引物对15、引物对16、引物对17、引物对18、引物对19、引物对20、引物对21、引物对22、引物对23、引物对24、引物对25、引物对26、引物对27、引物对28和引物对29；

所述引物对1由引物1-F和引物1-R组成；所述引物对2由引物2-F和引物2-R组成；所述引物对3由引物3-F和引物3-R组成；所述引物对4由引物4-F和引物4-R组成；所述引物对5由引物5-F和引物5-R组成；所述引物对6由引物6-F和引物6-R组成；所述引物对7由引物7-F和引物7-R组成；所述引物对8由引物8-F和引物8-R组成；所述引物对9由引物9-F和引物9-R组成；所述引物对10由引物10-F和引物10-R组成；所述引物对11由引物11-F和引物11-R组成；所述引物对12由引物12-F和引物12-R组成；所述引物对13由引物13-F和引物13-R组成；所述引物对14由引物14-F和引物14-R组成；所述引物对15由引物15-F和引物15-R组成；所述引物对16由引物16-F和引物16-R组成；所述引物对17由引物17-F和引物17-R组成；所述引物对18由引物18-F和引物18-R组成；所述引物对19由引物19-F和引物19-R组成；所述引物对20由引物20-F和引物20-R组成；所述引物对21由引物21-F和引物21-R组成；所述引物对22由引物22-F和引物22-R组成；所述引物对23由引物23-F和引物23-R组成；所述引物对24由引物24-F和引物24-R组成；所述引物对25由引物25-F和引物25-R组成；所述引物对26由引物26-F和引物26-R组成；所述引物对27由引物27-F和引物27-R组成；所述引物对28由引物28-F和引物28-R组成；所述引物对29由引物29-F和引物29-R组成；