[发明专利]基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产品中的应用

说明书

本发明公开了基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产品中的应用，本发明采用坏死性凋亡相关基因：BID、H2AFY2、MAPK9、TNFRSF10B作为检测靶标，构建的模型预测性能良好；构建结合坏死性凋亡相关基因风险评估模型和临床因素的列线图对生存率具有更高的预测性能,对模型中的高风险和低风险在免疫浸润方面的差异比较和预后模型对预后治疗的用药指导有望将基于坏死性凋亡相关基因构建的模型用于LGG患者预后和免疫治疗反应的临床预测。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，特别是涉及基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产品中的应用。

背景技术

胶质瘤是最常见的原发性中枢神经系统恶性肿瘤，据美国脑肿瘤注册中心统计，胶质瘤约占所有中枢神经系统恶性肿瘤的80％。WHO中枢神经系统分类将胶质瘤分为whoI-IV级，I、Ⅱ级为低级别，Ⅲ、IV级为高级别。低级别胶质瘤(low grade glioma,LGG)虽然只占20％,其治疗方案的选择，受诸多因素影响。低级别胶质瘤具有侵袭性生长、对放化疗耐药等恶性生物学特征，有发展为高级别胶质瘤的趋势。随着对其研究的逐渐深入，循证医学证据不断积累，尤其是分子病理诊断在临床实践中的应用，各权威指南对低分级脑胶质瘤临床诊疗方案的推荐均做出相应更新，同时因为对低分级脑胶质瘤的研究还很不深入，因此临床诊疗的许多环节还存在争议。因此，建立一种有效的低级别胶质瘤预后评估模型用于LGG患者预后和免疫治疗反应的临床预测是很有必要的。

近年来，坏死性凋亡的信号通路得到了广泛的研究。坏死性凋亡是一种依赖于RIPK1和RIPK3激酶活性的细胞死亡模式。坏死性凋亡与多种癌症密切相关，包括低级别胶质瘤，其形成受坏死小体、坏死凋亡小体等一系列因素调控。BID在细胞凋亡过程中起主要作用，并与特定类型胃癌的生长有关。MAPK9在NSCLC组织的正常组织中表达上调，CircRNF20通过激活MAPK9加速非小细胞肺癌进展。YIPF2通过增强TNFRSF10B向非小细胞肺癌细胞质膜的再循环来促进细胞凋亡，然而这些基因在LGG中的应用还未见报道。

发明内容

针对上述情况，本发明之目的在于提供基于坏死性凋亡相关基因(NECsig)组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤(LGG)预后产品中的应用。

其解决的技术方案是：

基于坏死性凋亡相关基因组合构建的模型在制备预测低级别胶质瘤预后产品中的应用。

进一步的，所述坏死性凋亡相关基因组合包括BID、H2AFY2、MAPK9、TNFRSF10B；所述BID、H2AFY2、MAPK9、TNFRSF10B的序列为SEQUENCELISTING所示。

进一步的，所述应用是通过检测所述坏死性凋亡相关基因组合的表达水平，从而预测低级别胶质瘤预后和指导临床应用。

进一步的，所述检测采用的试剂包括特异性扩增坏死性凋亡相关基因的上下游引物或者特异性识别坏死性凋亡相关基因的探针；所述上下游引物为SEQUENCE LISTING所示；所述产品包括试剂盒和芯片。

一种预测低级别胶质瘤预后的产品包括检测离体低级别胶质瘤组织样本中坏死性凋亡相关基因：BID、H2AFY2、MAPK9、TNFRSF10B表达水平的试剂。

进一步的，采用所述产品检测坏死性凋亡相关基因的表达水平，使用风险评分公式进行风险评分；其中，n为坏死性凋亡相关基因的数量，βi为坏死性凋亡相关基因的系数，expofmRNA为纳入风险评分系统的基因表达水平；所纳入组合的4个坏死性凋亡相关基因：BID、H2AFY2、MAPK9、TNFRSF10B的系数分别为–0.073、-0.047、-0.071、0.089；预测低级别胶质瘤预后情况时，风险评分临界值(0.87)将患者分为高风险组和低风险组。