[发明专利]与黄色菜花颜色相关的分子标记片段及其应用

说明书

本发明公开了与黄色菜花颜色相关的分子标记片段，其特征在于，所述分子标记片段的序列如SEQ ID NO:1所示，其中，在所述SEQ ID NO:1第102bp处发生Ins/Del突变，第102bp处碱基为Ins TGAGACACT时菜花颜色为黄色；或所述分子标记片段片段的序列如SEQ ID NO:2所示，其中，在所述SEQ ID NO:2第151bp处发生C/T突变，第151bp处碱基为CC时菜花颜色为黄色。可在幼苗阶段对菜花颜色进行准确预测，KASP基因分型技术可以大批量检测应用，有助于提高黄色菜花品种的鉴定效率，缩短鉴定时间。

技术领域

本发明涉及生物分子检测及育种领域，具体涉及与黄色菜花颜色相关的分子标记片段及其应用。

背景技术

菜花，又称花菜、花椰菜或椰菜花，是一种美味且富含营养的常见蔬菜。菜花叶片颜色不同，呈现出不同花色的菜花。相比白菜花，黄菜花因含有更高水平的植物色素，具有更多的营养价值。因此，选育黄色菜花品种具有很高的实用价值。

研究表明菜花中Pr基因编码的蛋白是R2R3 MYB，属于转录因子，与植物的颜色差异密切相关。(Chiu Li-Wei,et al.The purple cauliflower arises from activationof a MYB transcription factor.[J].Plant Physiol,2010,154:1470-80.)。Or基因编码具有富含DnaJ Cys结构域的蛋白，控制菜花有色体的形成，影响叶片颜色。(Lu Shan,etal.The cauliflower Or gene encodes a DnaJ cysteine-rich domain-containingprotein that mediates high levels of beta-carotene accumulation.[J].PlantCell,2006,18:3594-605.)。通过基因组测序，与参考基因组相比，寻找黄色菜花所具有的特征SNP变异及InDel变异，进行BSA关联分析，特别是针对Pr和Or基因上的多态位点进行菜花颜色关联分析，可以鉴定到与黄色菜花相关的多态性位点。

竞争性等位基因特异PCR(KASP)技术是近年来应用广泛的先进的分子标记片段技术，可以对基因组(DNA)中SNPs和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。KASP技术检测分子标记片段的方法是一种低成本、高通量的新型快捷的鉴定方法，在作物育种中应用较为广泛。然而目前尚缺少够区分黄色菜花品种的KASP分子标记片段。因此，开发菜花黄色颜色相关基因的KASP分子标记片段对于推广普及分子标记片段技术的应用，以及提高我国黄色菜花育种效率和育种水平具有重要意义。

发明内容

鉴于现有技术中的上述缺陷或不足，期望提供与菜花黄色颜色相关的分子标记片段及其应用。

本发明进一步提供了一种与黄色菜花颜色相关的分子标记片段，所述分子标记片段的序列如SEQ ID NO:1所示，其中，在所述SEQ ID NO:1第102bp处发生Ins/Del突变(InsTGAGACACT/Del TGAGACACT)突变，第102bp处碱基为Ins TGAGACACT时菜花颜色为黄色；

或所述分子标记片段片段的序列如SEQ ID NO:2所示，其中，在所述SEQ ID NO:2第151bp处发生C/T突变，第151bp处碱基为CC时菜花颜色为黄色；

一种扩增与菜花黄色颜色相关的分子标记片段的KASP引物，所述KASP引物包括上游引物1、上游引物2以及下游引物，其中，SEQ ID NO:1上游引物1的序列如SEQ ID NO:3所示，上游引物2的序列如SEQ ID NO:4所示，下游引物的序列如SEQ ID NO:5所示。