[发明专利]一种小麦矮杆基因Rht8的功能KASP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种小麦矮杆基因Rht8的功能KASP分子标记及其应用。具体地公开了检测小麦Rht8基因的第1649‑1650位核苷酸是否由“CG”突变为“T”的物质在鉴定或辅助鉴定小麦株高性状中的应用。本发明公开了核苷酸序列为SEQ ID No.1和/或2所示的分子标记。本发明提供了所述分子标记的引物组合物、含有所述引物组合物的试剂盒及利用所述引物组合物鉴定小麦株高的方法。本发明的KASP分子标记及其引物能够快速、精准、高通量地鉴定Rht8基因的矮杆等位型，可高效检测和追踪小麦品种/品系中基因Rht8，加快矮杆基因Rht8的高效育种利用，具有准确性高、特异性强、检测简单便捷，经济高效的特点。

技术领域

本发明属于分子生物学及遗传育种技术领域，具体地涉及一种小麦矮杆基因Rht8的功能KASP分子标记及其应用。

背景技术

小麦(Triticum aestivum L.)是世界上栽培最广泛的粮食作物，为人类提供了约21％的食物热量和20％的蛋白质。小麦也是我国的主要粮食作物之一，持续提高我国小麦产量水平对于确保国家粮食安全具有十分重要的意义。我国新的粮食安全战略目标为要确保谷物自给率保持在95％以上，其中水稻、小麦两大口粮保持100％自给。因此，随着人口不断增加和耕地面积的减少，培育高产优质小麦新品种，进一步提高我国小麦单产对于保障国家粮食安全具有重要的战略意义。

株高是影响小麦株型和产量的重要性状。降低株高可以增强小麦的抗倒伏能力，同时提高收获指数，从而实现小麦的增产与稳产。在小麦由中产向高产转变的过程中，生产上遇到的首要问题是因生产条件的改善而引起的倒伏问题。过去生产上延用的中高秆品种在高产条件下会出现严重倒伏而减产，抗倒伏是高产育种的主要目标之一。尽管倒伏还与茎秆的坚韧度、弹性、基部节间长度以及根的分布深度等特性有关，但株高仍是造成倒伏的主要因素。由于小麦矮秆品种具有茎秆矮、抗倒伏、收获指数高、水肥增产效应大等优点，因此提高了其产量潜力，改良了稳产性能。随着小麦产量水平的提高和生产条件的改善，小麦品种株高逐步矮化，进一步选育矮秆和半矮秆品种是现代小麦育种的发展趋势。因此，研究小麦株高的遗传决定机制，开发与小麦矮杆基因连锁的分子标记，从而利用该标记筛选矮杆基因的等位变异类型，为选育高产抗倒伏小麦品种奠定理论基础，对小麦品种改良至关重要。

KASP(竞争性等位基因特异性PCR，Kompetitive Allele Specific PCR)技术是一种基于PCR过程中引物末端碱基特异性匹配来实现SNP(Single NucleotidePolymorphisms，单核苷酸多态性)及InDel(insertion-deletion，插入缺失位点)检测分型的方法，能够精确地进行双等位基因分型，且通量高、成本低、效率高、准确度高、遗传稳定性好。KASP在小到中等数量的标记应用中显示出了成本效益和可扩展的灵活性，因此基于KASP技术挖掘鉴定小麦株高的KASP分子标记，用于筛选矮秆和半矮秆品种小麦，对小麦高产辅助选择育种具有重要价值。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何更快速、精准和/或高通量地鉴定或辅助鉴定小麦株高性状。所要解决的技术问题不限于所描述的技术主题，本领域技术人员通过以下描述可以清楚地理解本文未提及的其它技术主题。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了检测小麦Rht8基因的第1649-1650位核苷酸是否由“CG”突变为“T”的物质在鉴定或辅助鉴定小麦株高性状中的应用。

所述小麦Rht8基因的第1649-1650位核苷酸对应于小麦基因组中SEQ ID No.2的第64-65位。

上述应用中，所述物质含有扩增包含所述小麦Rht8基因的第1649-1650位核苷酸在内的小麦基因组DNA片段的PCR引物。

上述应用中，所述物质含有扩增包含分子标记在内的小麦基因组DNA片段的PCR引物，所述分子标记是核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的DNA分子和/或SEQ ID No.2所示的DNA分子。