[发明专利]用于鉴定凫峰1号茶树的SSR分子标记组合、指纹图谱及其应用有效
申请号: | 202210310184.6 | 申请日: | 2022-03-28 |
公开(公告)号: | CN114574622B | 公开(公告)日: | 2023-08-18 |
发明(设计)人: | 韦朝领;张操;刘升锐;陈辉;张红秀;陶玲玲;庭玉杰 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 张秋菊 |
地址: | 230036 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 茶树 ssr 分子 标记 组合 指纹 图谱 及其 应用 | ||
1.一种用于鉴定凫峰1号茶树的指纹图谱的构建方法,包括以下步骤:
以已知品种的不同茶树株系、品系或品种的基因组DNA为模版,分别利用引物组合进行PCR扩增,得到扩增产物,对扩增产物进行全自动毛细管电泳,以所述全自动毛细管电泳的结果作为茶树样品的身份信息,得到指纹图谱;所述茶树的品种包括凫峰1号;
所述引物组合为用于检测SSR分子标记组合的引物组合,包括第一引物对、第二引物对、第三引物对、第四引物对、第五引物对、第六引物对、和第七引物对;
所述第一引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.22和SEQ ID NO.23所示;
所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.24和SEQ ID NO.25所示;
所述第三引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.26和SEQ ID NO.27所示;
所述第四引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29所示;
所述第五引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31所示;
所述第六引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33所示;
所述第七引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.34和SEQ ID NO.35所示;
所述SSR分子标记组合为用于鉴定凫峰1号茶树的SSR分子标记组合,包括CsL02、CsL06、CsL15、CsL20、CsL67、CsL68和CsL69;
所述CsL02的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述CsL02标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述CsL02标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述CsL06的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述CsL06标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;所述CsL06标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
所述CsL15的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;所述CsL15标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;所述CsL15标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
所述CsL20的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;所述CsL20标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;所述CsL20标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;
所述CsL67的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;所述CsL67标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示;所述CsL67标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示;
所述CsL68的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示;所述CsL68标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示;所述CsL68标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示;
所述CsL69的核苷酸序列如SEQ ID NO.19所示;所述CsL69标记的SSR位点5’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.20所示;所述CsL69标记的SSR位点3’端的侧翼序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.21所示。
2.权利要求1所述构建方法构建得到的指纹图谱在鉴定凫峰1号和/或凫峰1号茶树辅助育种中的应用。
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