[发明专利]一种与大豆芽期耐低温相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用

说明书

本发明涉及大豆分子育种领域，具体涉及一种与大豆芽期耐低温相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用。所述QTL位于大豆第9号染色体的38426868bp‑38983456bp区间，所述分子标记为SSR‑09‑1126，所述分子标记位于大豆第9号染色体的38701572bp‑38701609bp区间，所述分子标记为SSR‑09‑1126的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。所述分子标记SSR‑09‑1126可用于分子标记辅助选择育种以及挖掘相关功能基因，同时可以利用野生资源，拓宽栽培大豆的遗传基础。

技术领域

本发明涉及大豆分子育种领域，具体涉及一种与大豆芽期耐低温相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用。

背景技术

种子萌发是植物生命周期中最重要的阶段之一。通常，胚根的出现表明种子萌发的完成。低温胁迫是植物生长发育和产量形成过程中主要的非生物胁迫因素之一，大豆种子萌发常受到低温胁迫，影响大豆的出苗率和出苗整齐度，进而影响大豆的产量。目前，低温对大豆种子萌发分子机理的影响在很大程度上还缺乏了解。针对芽期耐低温性状进行品种改良，对于提高大豆产量和品质具有重要意义。但是芽期耐低温属于复杂的数量性状，受多基因控制，传统育种周期长，难度大，需要耗费大量的人力物力。随着分子遗传学的发展，分子标记辅助选择育种为人们加快育种进程提供了新的途径。标记辅助选择育种是指在育种选择时通过对与功能基因相连锁的分子标记对目标性状进行间接选择。利用分子标记对数量性状基因座(quantitative trait locus，QTL)进行定位，是进行标记辅助选择育种的重要手段。目前国内外科研工作者已定位到的大豆芽期耐低温QTL较少，而且关于大豆芽期耐低温的QTL定位大部分都是初级定位，标记与目标性状距离过大，对其定位的精确性较差。QTL随机定位是在不同组合的不同遗传背景下发生多样化的重组过程，因此定位的QTL具有杂交组合特异性，标记区间过大，随着世代和遗传背景的改变可能会丧失，不利于应用。难于进行分子辅助选择。

发明内容

本发明提供了一种与大豆芽期耐低温相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用，所述的QTL位点，标记区间为0.56Mb，LOD值为4.18，其贡献率为10.59％，并鉴定了与大豆芽期耐低温相关的分子标记SSR-09-1126。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案:

本发明的第一个目的是提供一种与大豆芽期耐低温相关的QTL，所述QTL位于大豆第9号染色体的38426868bp-38983456bp区间。

本发明的第二个目的是提供一种与大豆芽期耐低温相关的所述所述QTL的SSR分子标记，所述分子标记为SSR-09-1126，大豆第9号染色体的38701572bp-38701609bp区间，所述分子标记为SSR-09-1126的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

本发明的第三个目的是提供了所述SSR分子标记的扩增引物，所述扩增引物如下：

SSR-09-1126F：5′-CTCAATCGCGAACCCTAAAC-3′；

SSR-09-1126R：5′-GTGCTCCGAAGGCTGTCTAC-3′。

本发明的第四个目的是提供所述扩增引物在大豆芽期耐低温性状鉴定中的应用。

本发明的第五个目的是提供了一种利用所述的扩增引物鉴定大豆芽期耐低温性状的方法，包括以下步骤：

S1、提取大豆待鉴定材料基因组DNA；

S2、利用SSR-09-1126扩增引物对待鉴定大豆材料进行PCR扩增；

S3、对扩增产物进行电泳分析，如果待鉴定大豆材料扩增产物的电泳带型属于SSR-09-1126中的1号带型，则鉴定为大豆芽期耐低温材料，如果待鉴定大豆材料扩增产物的电泳带型属于SSR-09-1126中的2号带型，则鉴定为大豆芽期低温敏感材料。