[发明专利]一种与鸡生长性状相关的KLHL31基因分子标记及应用

说明书

本发明公开了一种与鸡生长性状相关的KLHL31基因分子标记及应用，涉及生物技术领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，所述分子标记存在两个SNP位点，SNP1为NC_052534.1:g.87828628GC，SNP2为NC_052534.1:g.87828969CT。本发明通过分析KLHL31基因，发现该基因扩增片段区域有多个与鸡生长性状显著相关的SNP位点，并且通过试验验证，SNP1位点与91日龄体重存在显著相关(p0.05)；SNP2位点与77日龄体重和84日龄体重均存在显著相关(p0.05)。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种与鸡生长性状相关的KLHL31基因分子标记及应用。

背景技术

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸插入、缺失、颠换和转换等变异而引起的DNA序列的多态性。SNP是动物可遗传变异中最常见的一种，在动物基因组中广泛存在，具有稳定遗传，易于检测等特性。在动物生产实践中，SNP可用于分子标记辅助选择(Molecular Mark-assist Selection,MAS)，提高选种准确性和选育效果。找到与性成熟相关的有效的分子标记，可以为鸡的性生长性状的分子标记辅助选择育种提供有利的技术支撑。

KLHL31(Kelch like family member 31)是脊椎动物中Kelch样家族的成员，其编码的蛋白质含有保守的BTB结构域和串连重复的Kelch结构域。

发明内容

本发明的目的是提供一种与鸡生长性状相关的KLHL31基因分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题，本发明发现KLHL31基因扩增片段的SNP位点，并将其与鸡生长性状关联分析，为分子标记辅助选择提供新的SNP分子标记。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种与鸡生长性状相关的KLHL31基因分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述分子标记存在两个SNP位点，SNP1为NC_052534.1:g.87828628 GC，SNP2为NC_052534.1:g.87828969 CT。

进一步地，所述SNP1的基因型包括GG、GC和CC；所述SNP2的基因型包括CC、CT和TT。

本发明还提供一种鉴别鸡生长性状的引物对，所述引物对的序列如SEQ ID NO:2-3所示。

本发明还提供一种利用上述的分子标记鉴别鸡生长性状的方法，包括以下步骤：

(1)提取待测鸡基因组DNA，利用上述的引物对进行PCR扩增，获得扩增产物；

(2)对所述扩增产物测序，检测SNP1位点的基因型，当SNP1位点的基因型为GG时，则91日龄体重大；检测SNP2位点的基因型，当SNP2位点的基因型为CC时，则77日龄体重和84日龄体重大。

进一步地，在步骤(1)中，所述PCR扩增的引物对序列为SEQ ID NO:2-3所示序列。

进一步地，在步骤(1)中，扩增体系为：模板DNA 2μL、2×Rapid Taq Master Mix25μL、上游引物2μL、下游引物2μL、ddH₂O 19μL。

进一步地，在步骤(1)中，扩增反应程序为：95℃预变性3min；95℃变性15s，58℃退火15s，72℃延伸15s，35个循环；72℃彻底延伸3min；4℃保存。

本发明还提供一种鉴别鸡生长性状的试剂盒，包含上述的引物对。

本发明还提供上述的与鸡生长性状相关的KLHL31基因分子标记、引物对或试剂盒在鸡遗传育种中的应用。