[发明专利]用于通过细菌宏基因组分析来诊断胃癌的试剂盒和方法

说明书

本发明涉及用于通过细菌宏基因组分析来诊断胃癌的试剂盒和方法。提供了用于通过细菌宏基因组分析提供胃癌诊断的信息的试剂盒和方法，更具体地涉及用于经由使用来源于受试者的样品的细菌宏基因组分析通过分析来源于特异性细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来预测患胃癌的风险或诊断胃癌的试剂盒和方法。依本公开可通过使用来源于人体的样品对来源于细菌的EV的宏基因组分析来预测患胃癌，导致对患胃癌的高风险组的早期诊断和预测，故可延迟胃癌的发作或可通过适当控制预防胃癌，且即使在胃癌发生后也可实现对胃癌的早期诊断，降低胃癌发生率并提高治疗效果。

本申请是申请号为201710769238.4，申请日为2017年8月31日，申请人为阿昂梅迪克斯公司，发明创造名称为“用于通过细菌宏基因组分析来诊断胃癌的试剂盒和方法”的发明专利申请的分案申请。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2016年12月16日提交的韩国专利申请No.2016-0172584和2017年6月9日提交的韩国专利申请No.2017-0072432的优先权和权益，其公开内容通过引用整体并入本文。

技术领域

本公开涉及用于通过细菌宏基因组分析提供用于胃癌诊断的信息的试剂盒和方法，更具体地，涉及用于经由使用来源于受试者的样品的细菌宏基因组分析，通过分析来源于特异性细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来预测胃癌的风险或诊断胃癌的试剂盒和方法。

背景技术

在全球范围内，包括韩国、中国、日本等在内的东亚地区的胃癌发病率高，而在包含美国、欧洲等在内的西方国家的胃癌发病率相对较低。在韩国，胃癌在男女中发病率最高，具有次于肺癌的第二高的死亡率，在六十年代发病率最高。虽然非示例的胃癌包括胃粘膜上皮中发生的胃腺癌，粘膜下层、肌肉肉瘤和间质肿瘤中发生的恶性淋巴瘤，但胃腺癌占所有胃癌的95％。胃是从口中接收食物并长时间接触食物的器官，因此食物中含有的因子被高度预期成为胃癌的致病因子，食物中所含的致癌物质通过动物实验检测被认为是最关键的胃癌的因子。长期以来已经证明，由诸如病毒、细菌等生物因子引起的慢性炎症导致癌症。最近已经报道，结肠直肠癌是由来自肠内细菌的毒素的Th17免疫应答和由此引起的炎症反应造成的(Nat Commun.Wi 2015年4月24日；6：6956)，胃癌由在胃里共生的幽门螺旋杆菌(Helicobacter pylori)导致。

早期通过内窥镜检查等可以检测胃癌，并且通过适当的治疗，预期早期胃癌中约90％的病例被完全治愈。然而，仍然有许多病例在其进展后发现胃癌，胃癌也被归类为具有高死亡率的癌症。因此，通过预测胃癌的发病来区分用于早期诊断和治疗的区分应对方法是重要的，因此需要对其进行研究和技术开发。

同时众所周知，在人体内共生的微生物数量为100万亿，是人类细胞数的10倍，微生物的基因数超过人类基因数的100倍。微生物群(microbiota)或微生物菌群(microbiome)是一个微生物群落，其中包括在给定栖息地中存在的细菌、古细菌和真核生物。已知肠道微生物群在人类的生理现象中起着至关重要的作用，并通过与人类细胞的相互作用对人体健康和疾病产生重大影响。共存于人体中的细菌分泌纳米级的囊泡，以便与其他细胞交换关于基因、蛋白质等的信息。粘膜形成不允许200nm或200nm以上的粒子通过的物理阻隔膜，因此共生在粘膜中的细菌不能通过，但来源于细菌的细胞外囊泡具有大约为100nm或以下的尺寸，因此相对自由地通过粘膜并被吸收到人体内。

宏基因组学(也称为环境基因组学)是针对从自环境中收集的样品获得的宏基因组数据的分析学。最近，已经使用基于16s核糖体RNA(16s rRNA)碱基序列的方法列出了人类微生物群的细菌组成，并通过下一代测序(NGS)平台分析细菌的碱基序列来鉴定微生物。然而，关于胃癌的发生，没有关于从来源于人类的流体(例如血液、尿液等)通过对存在于来源于细菌的囊泡中的宏基因组和预测胃癌的分析来鉴定胃癌的致病因子的方法的报道。

发明内容