[发明专利]一种半叶马尾藻SSR标记及其扩增引物、检测方法和应用在审
申请号: | 202210387875.6 | 申请日: | 2022-04-13 |
公开(公告)号: | CN114959093A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 江晓;任春华;陈廷;罗鹏;胡超群;张鑫;王艳红 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 陈洁娣;刘明星 |
地址: | 511458 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 马尾藻 ssr 标记 及其 扩增 引物 检测 方法 应用 | ||
1.一种半叶马尾藻SSR标记,其特征在于,所述的SSR标记编号为S12、S16、S24、S31、S33、S39、S41、S53、S58、S72、S74、S85、S108和S143;
所述的S12的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述的S16的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
所述的S24的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述的S31的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
所述的S33的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
所述的S39的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
所述的S41的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;
所述的S53的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;
所述的S58的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
所述的S72的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;
所述的S74的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;
所述的S85的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;
所述的S108的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;
所述的S143的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示。
2.一种权利要求1所述的半叶马尾藻SSR标记的扩增引物,其特征在于,所述的扩增引物包括:
针对S12位点:
F12:5'-TTCATTTCAAGCATGTCCCA-3';
R12:5'-GTGGATTCCGAATGACGACT-3';
针对S16位点:
F16:5'-GAATAATGGCATCGTGGTCC-3';
R16:5'-GACGCGCTCGAATATTTGTT-3';
针对S24位点:
F24:5'-CGTTCCTTGTCGGAACATTT-3';
R24:5'-TGCTCTGTGCACCCACTTAC-3';
针对S31位点:
F31:5'-AGTACGCAAACGCTCCCTTA-3';
R31:5'-GCTTCGGATGAAAGATCAGC-3';
针对S33位点:
F33:5'-TACAGTTGCGGATAGTGGCA-3';
R33:5'-CCCTTCGTCGCGTCTTATTA-3';
针对S39位点:
F39:5'-GAAGGACGTGTACCTGGCAT-3';
R39:5'-CTCGCACTACAAACAGCAGC-3';
针对S41位点:
F41:5'-GTGACCACGGACTGGATCTT-3';
R41:5'-CGAAGCTGCACACCAAAGTA-3';
针对S53位点:
F53:5'-TTCTGATCTTGTGACCACGG-3';
R53:5'-CCCGGATAGATGAGGTTTGA-3';
针对S58位点:
F58:5'-TGTGACCACAAGTAGCCTGC-3';
R58:5'-CCATGATACCTTTGTCCGCT-3';
针对S72位点:
F72:5'-TGGCGTTACAAAGTGTGAGG-3';
R72:5'-CCGGTACCATTTCATTTGCT-3';
针对S74位点:
F74:5'-GGAGAACAGTCGGACACGAT-3';
R74:5'-GATCTCCACGGTAGAACCGA-3';
针对S85位点:
F85:5'-CGTCCCTTTGGAACACAGAT-3';
R85:5'-TAGCGATCGACACGTCAAAG-3';
针对S108位点:
F108:5'-ACGCTTGCGAAAGGACTATG-3';
R108:5'-TAGTTGGGTTGCCGTAGGTC-3';
针对S143位点:
F143:5'-AGTTTGTAATCGTGGGCTGG-3';
R143:5'-TGTGACCACAAGTAGCCTGC-3'。
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