[发明专利]用于DNA存储的编码方法及编码装置在审

专利信息
申请号: 202210441789.9 申请日: 2022-04-25
公开(公告)号: CN114822695A 公开(公告)日: 2022-07-29
发明(设计)人: 黄奕翼;戴俊彪 申请(专利权)人: 中国科学院深圳先进技术研究院
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00
代理公司: 北京国昊天诚知识产权代理有限公司 11315 代理人: 王思超
地址: 518055 广东省深圳*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 用于 dna 存储 编码 方法 装置
【说明书】:

本申请公开了一种用于DNA存储的编码方法及编码装置,所述方法包括:获取待编码的二进制序列,其中,二进制序列包括N个二进制单元,N为大于0的整数;根据预设的二进制单元与碱基单元的映射规则,分别获取与N个二进制单元中的各个二进制单元对应的碱基单元,其中,碱基单元中包括7个碱基,二进制单元中包括12个二进制位,碱基单元中的第一位碱基和第二位碱基为不同碱基,碱基单元中的第六位碱基和第七位碱基为不同碱基,碱基单元中的第二位碱基起至第六位碱基中的单碱基连续重复数量不超过2,碱基单元中的GC含量大于或等于0.4且小于或等于0.6;通过将获取到的N个碱基单元进行合并,获取与二进制序列对应的碱基序列。

技术领域

本申请涉及数据存储技术领域,尤其涉及一种用于DNA存储的编码方法及编码装置。

背景技术

随着全球信息的爆炸式增长,传统的将信息以二进制序列(也就是0和1组成的序列)存到硬盘、光盘、U盘等媒介的方式,由于存在使用次数有限、存储寿命短以及信息密度低等缺点,已经难以满足大规模数据存储的需求。目前,将脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)作为存储媒介已经成为一种趋势。

但是,针对如何提高在将信息编码存入碱基序列后,碱基序列在合成、测序时的准确率,还没有比较完善的解决方案。

发明内容

本申请公开一种用于DNA存储的编码方法及编码装置,以解决如何提高在将信息编码存入碱基序列后,碱基序列在合成、测序时的准确率的问题。

为了解决上述问题,本申请采用下述技术方案:

第一方面,本申请实施例提供了一种用于DNA存储的编码方法,包括:获取待编码的二进制序列,其中,所述二进制序列包括N个二进制单元,N为大于0的整数;根据预设的二进制单元与碱基单元的映射规则,分别获取与N个所述二进制单元中的各个所述二进制单元对应的所述碱基单元,其中,所述碱基单元中包括7个碱基,所述二进制单元中包括12个二进制位,所述碱基单元中的第一位碱基和第二位碱基为不同碱基,所述碱基单元中的第六位碱基和第七位碱基为不同碱基,所述碱基单元中的第二位碱基起至第六位碱基中的单碱基连续重复数量不超过2,所述碱基单元中的GC含量大于或等于0.4且小于或等于0.6;通过将获取到的N个所述碱基单元进行合并,获取与所述二进制序列对应的碱基序列,其中,所述碱基序列用于合成存储有与所述二进制序列对应的数据信息的DNA。

第二方面,本申请实施例提供了一种用于DNA存储的编码装置,包括:第一获取模块,用于获取待编码的二进制序列,其中,所述二进制序列包括N个二进制单元,N为大于0的整数;第二获取模块,用于根据预设的二进制单元与碱基单元的映射规则,分别获取与N个所述二进制单元中的各个所述二进制单元对应的所述碱基单元,其中,所述碱基单元中包括7个碱基,所述二进制单元中包括12个二进制位,所述碱基单元中的第一位碱基和第二位碱基为不同碱基,所述碱基单元中的第六位碱基和第七位碱基为不同碱基,所述碱基单元中的第二位碱基起至第六位碱基中的单碱基连续重复数量不超过2,所述碱基单元中的GC含量大于或等于0.4且小于或等于0.6;第三获取模块,用于通过将获取到的N个所述碱基单元进行合并,获取与所述二进制序列对应的碱基序列,其中,所述碱基序列用于合成存储有与所述二进制序列对应的数据信息的DNA。

第三方面,本申请实施例提供了一种电子设备,该电子设备包括处理器和存储器,所述存储器存储可在所述处理器上运行的程序或指令,所述程序或指令被所述处理器执行时实现如第一方面所述的方法的步骤。

第四方面,本申请实施例提供了一种可读存储介质,所述可读存储介质上存储程序或指令,所述程序或指令被处理器执行时实现如第一方面所述的方法的步骤。

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