[发明专利]一种用于胃癌辅助诊断的SNP标志物及其应用

说明书

本发明属于基因工程及肿瘤医学领域，公开了一种用于胃癌辅助诊断的SNP标志物及其应用。该标志物为rs7366775、rs72706172、rs138554234、rs9841504、rs11937064、rs11098765、rs10074991、rs77651534、rs36012714、rs863241、rs114080964、rs28749114、rs9381024、rs2294693、rs1679709、rs2585177、rs10105842、rs10087426、rs7849280、rs10509670、rs11187838和rs11851309的组合。该诊断试剂盒有较好效果。

发明领域

本发明属于基因工程及肿瘤医学领域，涉及胃癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用。

背景技术

胃癌是全球最常见的消化道恶性肿瘤，其发病率占恶性肿瘤的第五位，死亡率居第二位。据国际癌症研究署(IARC)估计，2018年全球胃癌新发病例103.3万人，占全部癌症新发病例的5.7％；胃癌死亡人数78.3万，占全部癌症死亡病例的8.2％。在我国，胃癌年龄标化发病率为22.7/10万，胃癌死亡率仅次于肺癌居我国恶性肿瘤第二位，每年46.4万人死于胃癌，约占全球胃癌死亡人数的47％。胃癌起病隐匿、进展迅速、预后较差，生存率低，严重影响患者健康，给家庭和社会带来了沉重的疾病负担。胃癌患者的预后与确诊时的分期密切相关，进展期胃癌术后5年生存率低于30％，而早期胃癌在积极治疗后5年生存率超过90％。然而由于胃癌缺乏特异性症状和体征，目前我国早期胃癌检出率不到10％，大多数患者首诊时已经是中晚期。随着人口基数的不断增大和胃癌期望寿命的延长，胃癌患病和死亡人数，将在未来相当长一段时期内给我国带来严重的负担，由此可见，如何精准识别早期胃癌、降低其发病率和死亡率已成为一个亟待解决的重大公共卫生问题。

胃癌是一种慢性复杂性疾病，是环境和遗传因素长期共同作用的结果，其形成是一个多因素、多阶段、复杂的过程，从慢性萎缩性胃炎、肠化生、不典型增生等癌前病变最终进展为胃癌。不过目前其确切发病机制还不是很清楚。遗传流行病学研究表明，个体遗传因素在胃癌发生发展中发挥重要的作用，不同的个体对环境暴露的反应存在易感性差异，这种易感性目前被认为是由个体的遗传因素所决定的。双生子研究表明，胃癌的遗传度为22％，提示遗传因素在胃癌的发生发展中扮演极其重要的角色。单核苷酸多态性(Singlenucleotide polymorphism，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，包括转换、颠换、缺失和插入。SNP是人类可遗传的变异中最常见的一种，它的存在被认为赋予了个体不同的表型和性状，并且影响个体对疾病(包括肿瘤)的易感性、以及对药物的反应性等，有助于深入阐明胃癌发生发展的分子机制，而且通过对潜在的胃癌特异遗传标志物的鉴定，更有利于胃癌的早期发现、精准预防和个体化治疗。

目前，胃癌初步诊断的方法主要包括病史询问、体格检查、实验室检查、胃肠X线检查、纤维内窥镜检查、脱落细胞学检查、B超以及CT检查、肿瘤标记物检测等。鉴别诊断主要依靠X线钡餐造影、胃镜和活组织病理检查。但临床常用的X线钡餐造影和纤维内窥镜检查仍存在许多弊端，如难以发现较小的肿瘤或癌前病变、检查存在盲区以及报告假阴性或假阳性结果等。虽然病理活组织检查是胃癌诊断的金标准，但由于需要做胃镜取胃部组织，具有侵入性，不适宜作为临床健康筛查的手段。

利用疾病易感的SNP谱早期辅助诊断疾病的发生，不仅灵敏、准确和快速，具有广阔的应用前景，而且通过SNP谱的构建，还可以实现对疾病作出前瞻性的“基因诊断”。近年来，利用SNP早期辅助诊断疾病的发生发展已经成为临床和科研工作者的研究热点，在包括胃癌在内的常见重大疾病早期辅助诊断上的应用价值已初见端倪。然而，目前还没有将SNP应用于胃癌辅助诊断的报道，若能筛选出胃癌的易感SNP作为生物标志物，并研制相应的诊断试剂盒，对我国胃癌的早期诊断和筛查必将是一次有力的推动，能够有效识别高危人群并针对性进行管理，从而降低胃癌发病率和死亡率，也为其药物筛选、药效评价及靶向治疗开辟了新的途径。

发明内容