[发明专利]用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物及其应用在审

专利信息
申请号: 202210465977.5 申请日: 2022-04-29
公开(公告)号: CN114891904A 公开(公告)日: 2022-08-12
发明(设计)人: 徐玉兵;陈禹;孟晓伟;肖玲;董沁 申请(专利权)人: 上海金域医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12N15/11;G16B40/20;G16B40/30;C12R1/01
代理公司: 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 代理人: 李海恬
地址: 201321 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 用于 儿童 asd 诊断 肠道 标志 及其 应用
【说明书】:

发明涉及一种用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物及其应用,属于生物标志物技术领域。该标志物选自CAG8、CAG10和CAG16丰度共变化组中的至少一组菌群;所述CAG8丰度共变化组为具有SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.12所示特征序列的菌群;所述CAG10丰度共变化组为具有SEQ ID NO.13‑SEQ ID NO.17所示特征序列的菌群;所述CAG16丰度共变化组为具有SEQ ID NO.18‑SEQ ID NO.22所示特征序列的菌群。该母源肠道菌群标志物能够在早期诊断儿童ASD,且具有高灵敏度及特异性的优势。且基因测序技术客观,不会受到主观影响,粪便样本具有无创、易于运输保存,利于开展大规模人群筛查。

技术领域

本发明涉及生物标志物技术领域,特别是涉及一种用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物及其应用。

背景技术

孤独症谱系障碍(Autism spectrum disorder,ASD)是一组精神发育障碍的统称,其核心临床表现为社交损伤、行为方式刻板和兴趣狭窄。来自世界各地的流行病学调查研究显示3-17 岁儿童ASD发病率逐年升高,目前大约为1/50。ASD患者生活终身难以自理,可能需要社会和家人长期照顾。ASD儿童成年后很难独立的生活和工作,可能需要家庭和社会终生的照顾,给家庭带来巨大的精神痛苦和给社会带来巨大的经济负担。2013年时,在美国和英国,一名ASD患者一生的治疗、护理等费用预计在140-240万美元之间。有研究预测到2025年,在美国这项费用将提高到450万美元左右。然而,目前还缺乏广泛适用的、高效的治疗ASD的方法。

基于ASD的早期诊断甚至超早期(2岁以下)诊断给予的早期干预对ASD的重大治疗意义。目前,临床上可以使用孤独症诊断访谈量表(Autism diagnostic interview-revised,ADI-R) 和孤独症诊断观察量表(Autism diagnostic observation scale,ADOS)等量表对3岁以上的 ASD儿童进行明确的诊断。然而,利用量表的诊断手段具有一定的主观性,诊断结果的重复性不佳;评估过程需要至少2名专业人员,并且整个评估过程可能长达4小时以上,占用极大的医疗成本并且评估过程中引起的疲劳也对ASD儿童具有不利影响;不仅如此,还不能对 3岁以下的儿童进行诊断。所以,发现具有超早期诊断能力并且适合大范围开展ASD筛查的客观生物标志物非常必要。

虽然目前还不明确ASD的确切病因,但是大量的研究显示遗传因素和环境因素可能共同在ASD的发生发展中扮演着角色。肠道菌群作为环境因素之一可能与ASD的发生发展有关。大量研究显示ASD儿童相对于正常发育儿童肠道菌群结构和组成显著不同,将正常儿童粪便移植于ASD儿童,ASD儿童的胃肠道紊乱症状和行为异常得到有效缓解,表明肠道菌群组成与ASD具有因果关系。

母亲可以通过多种方式,比如生产方式、母乳、皮肤接触等将自身的共生微生物传递给子代,这称为母源菌群的垂直传递,这种传递对子代肠道菌群的建立至关重要。已发表的研究发现ASD儿童和其母亲共有的肠道细菌的特征性变化与ASD的患病程度有关,提示肠道菌群的垂直传递可能与ASD的发生发展有关。

因此,可对ASD儿童母亲的肠道菌群组成进行研究,寻找能够具有高灵敏度及特异性的客观的早期筛查、诊断ASD的母源肠道细菌标志物。

发明内容

基于此,有必要针对上述问题,提供一种用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物,该母源肠道菌群标志物能够在早期诊断儿童ASD,且具有高灵敏度及特异性的优势。

一种用于儿童ASD诊断的母源肠道菌群标志物,选自CAG8、CAG10和CAG16丰度共变化组中的至少一组菌群;

所述CAG8丰度共变化组为具有SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.12所示特征序列的菌群;

所述CAG10丰度共变化组为具有SEQ ID NO.13-SEQ ID NO.17所示特征序列的菌群;

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