[发明专利]分离的Cas13蛋白及其应用在审
申请号: | 202210518826.1 | 申请日: | 2022-05-13 |
公开(公告)号: | CN116083398A | 公开(公告)日: | 2023-05-09 |
发明(设计)人: | 梁峻彬;梁兴祥;孙阳;徐辉;彭志琴;司凯威;皇甫德胜 | 申请(专利权)人: | 广州瑞风生物科技有限公司;浙江迅识生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/55;C12N15/113;C12N15/85;C12N5/10 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 李海恬 |
地址: | 510700 广东省广州市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分离 cas13 蛋白 及其 应用 | ||
1.分离的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白包含如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:70任一项所示序列;或与SEQ ID NO:1-7、SEQ ID NO:70任一项所示序列具有50%以上序列同一性的序列。
2.根据权利要求1所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白可与gRNA形成复合物。
3.根据权利要求2所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白可被gRNA引导至靶核酸。
4.根据权利要求3所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白可被gRNA引导至靶核酸,并靶向或修饰所述靶核酸。
5.根据权利要求4所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述靶核酸是RNA。
6.根据权利要求5所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述靶核酸是PTBP1 mRNA、AQp1mRNA、VEGFA mRNA、VEGFR1 mRNA或VEGFR2 mRNA。
7.根据权利要求1所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白来源于:与包含SEQID NO:1-SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:70任一项所示序列的蛋白来源相同的界、门、纲、目、科、属或种。
8.一种分离的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白包含以下基序1-15所示氨基酸序列:
基序1:L-x(3)-R-N-x-Y-[ST]-H
基序2:R-x(3)-K-x-[VI]-N-G-F-G-R
基序3:P-Y-[IV]-T-x(5)-Y-x-[IV]-x(2)-N-x-I-G-L
基序4:P-x-L-x(2)-D-x(3)-[NK]
基序5:P-x-[AC]-x-L-S-x(2)-[ED]-[LF]-P-A-x(2)-F
基序6:[LI]-P-x-K-L
基序7:[KT]-x-[AL]-x(2)-[KVE]-[IL]
基序8:A-[DRK]-x-L-x(2)-[DS]-[MI]-[MV]-x-[FW]-Q-P
基序9:K-L-T-x(2)-N
基序10:F-x-[HR]-[AF]-x(5)-[QR]
基序11:I-x-L-P-x-G-[LM]-F-x(3)-I
基序12:[LI]-I-x(2)-[YWF]-F
基序13:I-x(3)-I
基序14:[DN]-[TN]-E-x(2)-[IL]-[KR]-[VR]-Y-[KR]-x-Q-D
基序15:R-N-[SA]-[FA]-x-H-x(2)-Y
其中,A、F、C、U、D、N、E、Q、G、H、L、I、K、O、M、P、R、S、T、V、W、Y为标准氨基酸代码,“x”为任意氨基酸,x后的括号内的数字表示连续的多个x,“[]”内为择一可选氨基酸代码,“-”为分隔符。
9.根据权利要求8所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白包含如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:70任一项所示序列,或与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:70任一项所示序列具有50%以上序列同一性的序列。
10.根据权利要求9所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白的氨基酸序列中除基序1-15所确定氨基酸以外的任意氨基酸残基,在野生型序列基础上进行氨基酸保守性替换,所述野生型序列包括SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:70所示序列。
11.根据权利要求8所述的Cas13蛋白,其特征在于,所述Cas13蛋白可与gRNA形成复合物。
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