[发明专利]一种精巧扁脑珊瑚微卫星位点及应用

说明书

本发明属于分子生物学技术领域，具体公开了一种精巧扁脑珊瑚微卫星位点，微卫星位点为JQ1026、JQ1086、JQ1610和JQ55中的一个或两个以上，JQ1026、JQ1086、JQ1610和JQ55的核苷酸序列分别为SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.4。本发明还公开了上述精巧扁脑珊瑚微卫星位点在群体遗传结构分析、亲权鉴定和/或分子标记辅助育种中的应用。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，尤其涉及一种精巧扁脑珊瑚微卫星位点及应用。

背景技术

微卫星DNA，又称作短串连重复(STRs)、简单重复序列(SSRs)、简单序列长度多态性(SSLP)，是指基因组中以1～6个核苷酸为单位串联组成的核苷酸序列。微卫星标记具有分布广泛、多态性信息容量高、呈共显性、符合孟德尔分离规律、易于PCR扩增、再现性佳等优点，已被广泛应用于海洋生物的群体遗传结构分析、亲权鉴定、遗传连锁图谱构建、功能基因定位和遗传育种等领域。

珊瑚礁生态系统一直被认为是世界上生物多样性最高的生态系统之一，有着极其重要的生态、经济及文化价值，为至少四分之一已知的海洋物种提供栖息地，并且具有防止国土流失的功能。精巧扁脑珊瑚(Platygyra daedalea,ellissolander 1786)属于石珊瑚目、蜂巢珊瑚科、扁脑珊瑚属，广泛分布于印度-太平洋区及我国南海海域。珊瑚骼凸形或亚球形，或枝柱块形，长谷多、短谷较少，长谷达80mm，短谷只有5mm。

目前，珊瑚礁在全球范围内已经出现严重退化，我国珊瑚礁也呈现同样严重的退化趋势，在过去30年间近岸珊瑚礁退化了至少80％。精巧扁脑珊瑚种群间的连通性是实施适当保护和恢复措施的重要依据。为了保护精巧扁脑珊瑚的野生种质资源，制定相应的保护策略，对其进行群体遗传多样性分析、群体遗传结构分析等相关工作已经非常迫切。

发明内容

本发明的目的在于提供一种精巧扁脑珊瑚微卫星位点及应用，以解决上述技术问题。

为了达到上述目的，本发明目的之一在于提供一种精巧扁脑珊瑚微卫星位点，所述微卫星位点为JQ1026、JQ1086、JQ1610和JQ55中的一个或两个以上，JQ1026、JQ1086、JQ1610和JQ55的核苷酸序列分别为SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.4。

本发明目的之二在于提供上述精巧扁脑珊瑚微卫星位点的在群体遗传结构分析、亲权鉴定和/或分子标记辅助育种中的应用。

优选地，扩增JQ1026微卫星位点的引物对核苷酸序列为SEQ ID NO.5和SEQ IDNO.6。

优选地，扩增JQ1086微卫星位点的引物对核苷酸序列为SEQ ID NO.7和SEQ IDNO.8。

优选地，扩增JQ1610微卫星位点的引物对核苷酸序列为SEQ ID NO.9和SEQ IDNO.10。

优选地，扩增JQ55微卫星位点的引物对核苷酸序列为SEQ ID NO.11和SEQ IDNO.12。

本发明的有益效果：

本发明提供的四个精巧扁脑珊瑚的新的微卫星位点分别命名为JQ1026、JQ1086、JQ1610、JQ55，核苷酸序列分别为SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.4。

本发明提供了四个精巧扁脑珊瑚的新的微卫星位点及扩增这四个微卫星位点的引物序列(SEQ ID NO.5-SEQ ID NO.12)，可应用于精巧扁脑珊瑚的群体遗传结构分析、亲权鉴定及分子标记辅助育种等领域的研究，重复性好，是一种可靠有效的分子标记。

附图说明

图1和图2为JQ1026位点的特异性引物扩增四个精巧扁脑珊瑚个体的毛细管电泳信号图；