[发明专利]玉米抗纹枯病相关基因的KASP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种玉米抗纹枯病相关基因的KASP分子标记及其应用，该分子标记是与玉米抗纹枯病相关基因FBL紧密连锁的KASP标记KASP_FBL。位于玉米4号染色体的第180199014位，该位点的碱基为A或者C。该标记基于KASP技术开发，可高通量检测玉米基因组4号染色体的第180199014位碱基。本发明应用KASP技术对玉米抗纹枯病相关基因FBL进行基因型鉴定，具有操作简便、成本低廉、检测周期短、标记稳定、绿色环保等优点，可精准检测玉米抗纹枯病相关基因FBL，对促进玉米抗纹枯病相关育种具有重要意义。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其是涉及与玉米抗纹枯病相关基因的KASP分子标记及其应用。

背景技术

玉米纹枯病主要是由腐生营养真菌R.Solani导致的玉米疾病，这种疾病在中国以及亚洲南部和东南部频发，已经严重影响了玉米的产量。

目前，抗纹枯病的玉米品种得到了选育，但是利用基因手段来得到抗纹枯病的种植资源还未有应用。同时，也开发了与基因连锁的分子标记，通过分子标记辅助选择技术(Marker-assisted Selection，MAS)进行玉米抗纹枯病相关的育种工作，弥补了传统育种中出现的诸多弊端，成为解决品种选育难这一问题的有效途径。

然而，玉米抗纹枯病相关基因的连锁标记虽然可以用于分子标记辅助选择，但多为CAPS标记、SSR标记、InDel标记或酶切标记，检测效率低，同时还可能会产生气溶胶污染环境，不适用于高通量的分子检测平台。因此，开发低成本、可高通量检测的分子标记是促进玉米抗纹枯病相关基因鉴定与提高育种效率的迫切需求。

KASP(Kompetitive Allele-Specific PCR，竞争性等位基因特异性PCR)通过荧光探针特异性识别基因位点达到基因分型的效果，可快速检测SNP位点。与SSR、 RFLP、InDel等分子标记相比，KASP标记具有检测快速，成本低，易于规模化应用等特点，KASP标记不需要根据DNA片段大小进行分型，能够摆脱传统凝胶电泳这种步骤相对繁琐，低通量，价格又较贵的检测方法，更加适用于现阶段飞速发展的高通量分子检测平台。因此，开发低成本、适合于高通量分子检测平台的玉米抗纹枯病相关基因KASP分子标记对于推广普及分子标记技术的应用、提高我国玉米抗纹枯病相关育种效率和育种水平具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供用于检测与玉米抗纹枯病相关基因FBL紧密连锁的KASP分子标记位点的多态性或基因型的物质及其应用。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现：

用于检测与玉米抗纹枯病相关基因FBL紧密连锁的KASP分子标记位点的多态性或基因型的物质在如下(1)、(2)或(3)中的应用：

(1)鉴定或辅助鉴定抗纹枯病玉米；

(2)制备用于鉴定或辅助鉴定抗纹枯病玉米的相关产品；

(3)玉米辅助育种或制备用于玉米辅助育种的产品。

作为一种优选技术方案，所述的与玉米抗纹枯病相关基因FBL紧密连锁的KASP 分子标记位点是玉米基因组中的一个SNP位点，位于玉米4号染色体的第 180199014位，为SEQID No.4的第83位核苷酸，该位点的碱基为A或者C。

该KASP分子标记KASP_FBL是基于玉米抗纹枯病相关基因FBL中一个SNP 位点开发的分子标记，所述SNP位点锚定在玉米4号染色体的第180199014位，该 SNP侧翼序列如SEQID No.4所示。KASP_FBL位于SEQ ID No.4的第83位，该处的碱基为C或A。