[发明专利]菜心分枝性状主效QTL的KASP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种菜心分枝数主效QTL的KASP分子标记及其应用，所述的主效QTL定位在菜心的A07染色体上，命名为qBrTL1；所述的qBrTL1定位区间为KASP标记A0716和A0717之间的34.24cM区间内，可解释20.81％的表型变异，加性效应为1.52；所述qBrTL1包括两个连锁的KASP分子标记为A0716和A0717，A0716是根据A07染色体第28007027bp碱基呈现多态性开发，其碱基为A或G，A0717是根据A07染色体第28031606bp处碱基呈现多态性开发，其碱基为T或G。本发明的两个KASP分子标记可实现菜心分枝性状的高通量、苗期快速辅助选择，提高选择效率，加速育种进程，为多分枝菜心的分子育种提供了一种新的遗传标记。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，具体为菜心分枝性状主效QTL的KASP分子标记及其应用。

背景技术

菜心(Brassica campestris L.ssp.Chinensis var.utilis Tsen et Lee)又名菜薹，是一种以花薹为食用器官的十字花科芸薹属芸薹种中的一二年生草本植物(张华等，2010；黄秀等，2017)，原产于广东，是我国南方地区的特色蔬菜(陈汉才等,2021)，栽培面积广。普通菜心品种主花序生长优势显著，生产上每株通常只收获1个花薹，产量相较于广东地区特色品种增城菜心低，增城菜心在近地面茎基部能形成15个左右的多侧枝，一次种植可以多次收获，侧枝作为商品器官，其数量可以作为来衡量菜心产量的标准(刘乐承等，1998)，因此，选育多分枝菜心品种具有重要的意义。

菜心分枝数是数量性状，其形成的机理非常复杂，分枝数容易受到环境的影响，因此基于表型选择的传统常规育种方法对复杂数量性状的选择效果不好，育种周期长、选择效率低，育种周期延长，已经无法完全满足当前菜心育种的需要。分子标记技术和数量遗传学结合，可以将复杂的数量性状分解为单个的数量性状基因位点(quantitative traitloci,QTL)，然后像研究质量性状一样对控制数量性状的多个基因进行研究利用QTL定位可以确定影响数量性状的基因位点和位置。分子标记辅助育种是将分子遗传学与传统的表型选择有效结合的一种新的手段，直接利用与目标性状基因紧密连锁或共分离的分子标记对个体进行目标区域以及全基因组筛选，以达到提高目标性状选择效率、缩短育种年限的目的。分子标记辅助选择育种技术的关键是鉴定与重要农艺性状紧密连锁的DNA分子标记。目前KASP已经成功应用于基因分型，通过构建遗传图谱挖掘和性状相关的基因。KASP标记不会受到碱基种类和位点的局限，可以对Indel和SNP进行检测。利用KASP标记结合表型数据再通过QTL mapping软件可以实现候选基因的精细定位。

培育多分枝的菜心品种是提高菜心产量和经济效益的有效途径。目前鉴定的控制菜心分枝数基因很少，尚不能满足分子育种的需要。因此，发掘菜心分枝性状的主效QTL并开发与其紧密连锁的分子标记对多分枝菜心品种分子标记辅助选择育种具有重要的意义。

发明内容

本部分的目的在于概述本发明的实施方式的一些方面以及简要介绍一些较佳实施方式。在本部分以及本申请的说明书摘要和发明名称中可能会做些简化或省略以避免使本部分、说明书摘要和发明名称的目的模糊，而这种简化或省略不能用于限制本发明的范围。

鉴于现有技术中存在的问题，提出了本发明。

为解决上述技术问题，根据本发明的一个方面，本发明提供了如下技术方案：

菜心分枝性状主效QTL的KASP分子标记及其应用，所述A0716的KASP分子标记引物序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。

所述A0717的KASP分子标记引物序列如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。