[发明专利]基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法及系统在审

专利信息
申请号: 202210589555.9 申请日: 2022-05-27
公开(公告)号: CN114974402A 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 王彪;孟庆春;赵培忻;冯俊娥 申请(专利权)人: 山东大学
主分类号: G16B5/10 分类号: G16B5/10;G16B20/00;G16B50/30;G06F17/12;G06F17/16
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 张庆骞
地址: 250014 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 基于 数据 观测 基因 调控 网络 辨识 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,包括以下步骤:

将数据库中输入数据和观测数据向量化;

利用向量化后的输入数据和观测数据,构建符合该基因调控网络的测试输入序列组用以区分状态;

基于测试输入序列组构造有效输入序列组;

检索数据库中输入数据是否存在有效输入序列组;若存在,则根据有效输入序列组及相应的有效观测序列组,辨识有效状态序列组;若不存在,则说明数据库数据不足,找到满足测试输入序列组的可区分样本,向这些样本注入有效输入序列组,收集相应的有效观测序列组;

根据有效输入序列组、有效观测序列组和有效状态序列组,构造系统的状态转移结构矩阵和输出转移结构矩阵;从而建立基因调控网络的动态方程;

根据动态方程写出基因调控网络的真值表,对应真值表完成数据辨识。

2.根据权利要求1所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,将数据库中输入数据和观测数据向量化的具体步骤为:将t时刻输入数据向量化为将t时刻观测数据向量化为其中记号代表2m阶单位矩阵的第jt列向量,记号代表2l阶单位矩阵的第lt列向量。

3.根据权利要求1所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,利用向量化后的输入数据和观测数据,构建符合该基因调控网络的测试输入序列组用以区分状态,具体步骤为:根据向量化后的输入数据和观测数据,检索可区分状态的测试输入序列组{U1(c),U2(c),...,UN(c)};在测试输入序列组下,每个状态所生成的观测序列Di,i∈{1,2,...,2n}是互不相同的;

根据观测序列Di,i∈{1,2,...,2n}出现的次序,依次将生成Di的系统状态辨识为

4.根据权利要求3所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,所述检索方法为:

可区分状态的测试输入序列组{U1(c),U2(c),...,UN(c)}按照下述条件检索:

其中,N:=22n-1-2n-1,代表由状态在输入序列Us(c)下生成的观测序列,s∈{1,2,...,N},记号代表2n阶单位矩阵的第i列向量,Di=(Yi,1,Yi,2,...,Yi,N)中的指标i是按照不同观测数据出现的先后顺序标记的,并将生成该数据的系统状态辨识为若系统可观测,在充足的数据中可检索到2n个不同的Di,i∈{1,2,...,2n};

或者,所述有效输入序列组的构造方法为:

根据所述测试输入序列组Us(c),s∈{1,2,...,N},构造有效输入序列组

其中N:=22n-1-2n-1,记号代表2m阶单位矩阵的第j列向量。

5.根据权利要求1所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,基于测试输入序列组,构造有效输入序列组,具体步骤为:

根据所述测试输入序列组Us(c),s∈{1,2,...,N},构造有效输入序列组

其中N:=22n-1-2n-1,记号代表2m阶单位矩阵的第j列向量。

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