[发明专利]基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法及系统在审
申请号: | 202210589555.9 | 申请日: | 2022-05-27 |
公开(公告)号: | CN114974402A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 王彪;孟庆春;赵培忻;冯俊娥 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | G16B5/10 | 分类号: | G16B5/10;G16B20/00;G16B50/30;G06F17/12;G06F17/16 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 张庆骞 |
地址: | 250014 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 数据 观测 基因 调控 网络 辨识 方法 系统 | ||
1.一种基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,包括以下步骤:
将数据库中输入数据和观测数据向量化;
利用向量化后的输入数据和观测数据,构建符合该基因调控网络的测试输入序列组用以区分状态;
基于测试输入序列组构造有效输入序列组;
检索数据库中输入数据是否存在有效输入序列组;若存在,则根据有效输入序列组及相应的有效观测序列组,辨识有效状态序列组;若不存在,则说明数据库数据不足,找到满足测试输入序列组的可区分样本,向这些样本注入有效输入序列组,收集相应的有效观测序列组;
根据有效输入序列组、有效观测序列组和有效状态序列组,构造系统的状态转移结构矩阵和输出转移结构矩阵;从而建立基因调控网络的动态方程;
根据动态方程写出基因调控网络的真值表,对应真值表完成数据辨识。
2.根据权利要求1所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,将数据库中输入数据和观测数据向量化的具体步骤为:将t时刻输入数据向量化为将t时刻观测数据向量化为其中记号代表2m阶单位矩阵的第jt列向量,记号代表2l阶单位矩阵的第lt列向量。
3.根据权利要求1所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,利用向量化后的输入数据和观测数据,构建符合该基因调控网络的测试输入序列组用以区分状态,具体步骤为:根据向量化后的输入数据和观测数据,检索可区分状态的测试输入序列组{U1(c),U2(c),...,UN(c)};在测试输入序列组下,每个状态所生成的观测序列Di,i∈{1,2,...,2n}是互不相同的;
根据观测序列Di,i∈{1,2,...,2n}出现的次序,依次将生成Di的系统状态辨识为
4.根据权利要求3所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,所述检索方法为:
可区分状态的测试输入序列组{U1(c),U2(c),...,UN(c)}按照下述条件检索:
其中,N:=22n-1-2n-1,代表由状态在输入序列Us(c)下生成的观测序列,s∈{1,2,...,N},记号代表2n阶单位矩阵的第i列向量,Di=(Yi,1,Yi,2,...,Yi,N)中的指标i是按照不同观测数据出现的先后顺序标记的,并将生成该数据的系统状态辨识为若系统可观测,在充足的数据中可检索到2n个不同的Di,i∈{1,2,...,2n};
或者,所述有效输入序列组的构造方法为:
根据所述测试输入序列组Us(c),s∈{1,2,...,N},构造有效输入序列组
其中N:=22n-1-2n-1,记号代表2m阶单位矩阵的第j列向量。
5.根据权利要求1所述的基于数据的可观测类基因调控网络的辨识方法,其特征是,基于测试输入序列组,构造有效输入序列组,具体步骤为:
根据所述测试输入序列组Us(c),s∈{1,2,...,N},构造有效输入序列组
其中N:=22n-1-2n-1,记号代表2m阶单位矩阵的第j列向量。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于山东大学,未经山东大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202210589555.9/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法、数据系统、接收设备和数据读取方法
- 数据记录方法、数据记录装置、数据记录媒体、数据重播方法和数据重播装置
- 数据发送方法、数据发送系统、数据发送装置以及数据结构
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法及数据系统
- 数据嵌入装置、数据嵌入方法、数据提取装置及数据提取方法
- 数据管理装置、数据编辑装置、数据阅览装置、数据管理方法、数据编辑方法以及数据阅览方法
- 数据发送和数据接收设备、数据发送和数据接收方法
- 数据发送装置、数据接收装置、数据收发系统、数据发送方法、数据接收方法和数据收发方法
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置