[发明专利]microRNA生物标志物在肺癌诊断或预测预后中的应用在审
申请号: | 202210602301.6 | 申请日: | 2022-05-30 |
公开(公告)号: | CN114990215A | 公开(公告)日: | 2022-09-02 |
发明(设计)人: | 陈碧;刘颖;张文辉;吕茜;李阳;张有为;张毛为;季磊;张蕊;高志康 | 申请(专利权)人: | 徐州医科大学附属医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G16B25/10;G16B30/00;G16H50/30 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 高倩倩 |
地址: | 221006 江苏省徐州市淮*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | microrna 生物 标志 肺癌 诊断 预测 预后 中的 应用 | ||
1.检测样本中生物标志物的试剂在制备肺癌诊断或预测预后产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物包括miR-219a-1、miR-153-2、miR-188、miR-186、miR-607、miR-576、miR-597、miR-642a、miR-656、miR-892a、miR-658、miR-543、miR-5581、miR-934、miR-632、miR-559、miR-625、miR-545、miR-296、miR-581、miR-639、miR-891a、miR-643、miR-369、miR-487a、miR-3154、miR-4664、miR-3652、miR-6502和/或miR-3166;
优选地,所述生物标志物包括miR-219a-1、miR-3154、miR-4664、miR-581、miR-597、miR-625、miR-632、miR-639和/或miR-656;
优选地,所述生物标志物包括miR-3154、miR-4664、miR-581、miR-597、miR-625、miR-632、miR-639和miR-656;
优选地,所述肺癌为肺鳞状细胞癌。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括使用实时定量PCR、印记杂交、原位杂交、阵列杂交、基因芯片或新一代测序来检测所述生物标志物表达水平的试剂。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂选自特异性识别所述生物标志物的寡核苷酸探针或特异性扩增所述生物标志物的引物。
4.一种用于肺癌诊断或预测预后的产品,其特征在于,所述产品包括检测待测样本中生物标志物的试剂,所述生物标志物为miR-219a-1、miR-153-2、miR-188、miR-186、miR-607、miR-576、miR-597、miR-642a、miR-656、miR-892a、miR-658、miR-543、miR-5581、miR-934、miR-632、miR-559、miR-625、miR-545、miR-296、miR-581、miR-639、miR-891a、miR-643、miR-369、miR-487a、miR-3154、miR-4664、miR-3652、miR-6502和/或miR-3166;
优选地,所述产品包括试剂盒;
优选地,所述试剂盒包括特异性结合所述生物标志物的引物、探针或芯片;
优选地,所述芯片包括固相载体、附着在固相载体上的特异性识别所述生物标志物的探针;
优选地,所述肺癌为肺鳞状细胞癌。
5.根据权利要求4所述的产品,其特征在于,所述样本选自外周血样本、血清样本、血浆样本、尿样本、唾液样本或组织样本。
6.一种预测肺癌预后风险模型,其特征在于,所述预后风险模型以权利要求1中所述的生物标志物作为输入变量;所述其中,N为用于预测预后的基因数,Expi为每个基因的表达水平,Ci为每个基因的回归系数;当风险评分较高时,患者预后不良;当风险评分较低时,患者预后良好;
优选地,所述预后风险模型为Cox回归模型;
优选地,所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型;
优选地,所述基因为miR-3154、miR-4664、miR-581、miR-597、miR-625、miR-632、miR-639和miR-656;
优选地,风险评分=-0.229*Exp(miR-3154)+0.138*Exp(miR-4664)-0.118*Exp(miR-581)+0.243*Exp(miR-597)-0.007*Exp(miR-625)-0.029*Exp(miR-632)-0.085*Exp(miR-639)-0.141*Exp(miR-656);
优选地,所述肺癌为肺鳞状细胞癌。
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