[发明专利]由miRNA-211和H2 在审
申请号: | 202210620605.5 | 申请日: | 2022-06-01 |
公开(公告)号: | CN114958968A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 陈文慧;邝敬宇;沈薇;张景慧;唐盛;李婷婷;姚瑶 | 申请(专利权)人: | 江苏科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6886;C12N15/113;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 余俊杰 |
地址: | 212100 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | mirna 211 base sub | ||
1.由miRNA-211和H2S协同触发的3D DNA network结构,其特征在于,所述3D DNAnetwork结构包括DNA-立方体框架、Ag NPs和由miRNA-211作为引发链形成的长双链DNA轨道,其中,10nM DNA-立方体框架、7.8ppm Ag NPs和300nM长双链DNA轨道的混合体积比为1:1:40;其中,Ag NPs嵌入DNA-立方体框架内,并与长双链DNA轨道自组装形成网络结构。
2.权利要求1所述由miRNA-211和H2S协同触发的3D DNA network结构的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、制备Ag NP/ssDNA复合物
将NaBH4溶于冰的超纯水中,磁力搅拌下向其中缓慢滴加AgNO3溶液,反应停止后离心、水洗,制得Ag NPs;取ssDNA与Ag NPs混合,振荡、静置交替进行,然后静置时间持续4h孵育,孵育结束后逐次加入NaCl,使体系中NaCl最终浓度达到0.3M,室温下老化12h。离心后使用0.1M PBS洗涤,形成Ag NP/ssDNA复合物;
S2、制备DNA-立方体框架
M13 mp18 DNA与订书钉链混合,遵循一定的退火过程:95℃-70℃,每5℃为一个梯度,每梯度保持5min;70℃-50℃,每2℃为一个梯度,每梯度保持10min;50℃-20℃,每1℃为一个梯度,每梯度保持15min,形成DNA-立方体框架;
S3、制备长双链DNA轨道
将两种发夹DNA,分别为HP1、SEQ ID NO.1,HP2、SEQ ID NO.2,在95℃加热5min,缓慢冷却至室温,取miRNA-211加入等量的HP1、HP2混合溶液中,37℃水浴下反应2h,触发HCR反应形成长双链DNA轨道;
S4、制备3D DNA network结构
将Ag NP/ssDNA复合物溶解于DNA-立方体框架中,再与S3中的HCR反应液等体积混合,在PCR仪中构筑3D DNA network结构;退火程序如下:25℃,10s;35℃,10s;40℃,1min;45℃,10min;40℃,1h;35℃,1h;30℃,1h;25℃,1h;20℃,1h;15℃,1h;10℃,1h;4℃,1h;
S5、分离3D DNA network结构
采用由DNA 1修饰的石英棒从反应体系中提取3D DNA network结构,将石英棒切割并浸没于DNA 1溶液中,涡旋震荡至少2h;然后转移至DNA 2溶液中,37℃水浴条件下孵育1h,所得溶液在4℃保存。
3.根据权利要求2所述的由miRNA-211和H2S协同触发的3D DNA network结构的制备方法,其特征在于,S1中NaBH4水溶液的浓度为4mM,NaBH4和AgNO3的摩尔比为1:1,500nM ssDNA与7.8ppm Ag NPs混合的体积比为2:1。
4.根据权利要求2所述的由miRNA-211和H2S协同触发的3D DNA network结构的制备方法,其特征在于,S1中ssDNA浓度为500nM;PBS为0.1M,包括0.1M NaCl,10mM磷酸盐。
5.根据权利要求2所述的由miRNA-211和H2S协同触发的3D DNA network结构的制备方法,其特征在于,S1中滴加AgNO3溶液的反应时间为10min,离心条件为8000rpm离心5min;ssDNA与Ag NPs混合后振荡5min、静置25min、重复上述震荡后静置孵育。
6.根据权利要求2所述的由miRNA-211和H2S协同触发的3D DNA network结构的制备方法,其特征在于,S2中M13 mp18 DNA与订书钉链混合的摩尔比为1:10。
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