[发明专利]与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记及其应用

说明书

本发明属于分子标记技术领域，公开了一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记，所述InDel分子标记的连锁基因位点开始于西瓜参考基因组97103V2版本的第2号染色体第16217471bp位碱基处，所述InDel分子标记的扩增长度为122bp和/或142bp，若扩增基因片段长度为122bp则为西瓜叶片黄化纯合单株，若扩增基因片段长度为142bp则为西瓜叶片正常绿纯合单株，若扩增基因片段长度为122bp和142bp则为西瓜叶片正常绿杂合单株。本发明开发的InDel分子标记，可以用来对品种进行初期筛选，检测方法正确可靠，达到分子标记辅助育种的目的，能够大大缩短育种周期，具有重要的理论及实践意义。

技术领域

本发明属于分子标记技术领域，涉及一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记及其应用。

背景技术

作为一种重要的葫芦科作物，西瓜(Citrulluslanatus)是人们夏季消暑解渴的重要水果，在世界园艺作物中占有非常重要的地位。中国作为世界上西瓜生产和消费第一大国，在生产栽培中，叶片颜色常常会发生变突变，表现出白化、黄绿、延迟变绿、斑驳、斑点等表型。叶色突变体是研究光合作用、叶绿素合成以及叶绿体发育的理想材料，同时也是遗传和育种中重要的研究材料。

在传统的选择育种中，因为难以确定后代的基因型，选择的依据通常是植物的表现型而不是基因型，选择时间较长，且表现型易受环境因素的影响，导致选择的不准确和效率较低。分子标记辅助育种以与目标性状紧密连锁分子标记为工具对目标性状进行筛选，通过分子标记以基因型进行种质资源的筛选，具有准确、快速、不受环境条件干扰的优点，避免了传统育种过程中性状选择的盲目性，提高了育种效率。InDel标记是对扩增产物进行分析的一种分子标记，具有高通量、简单、稳定、灵敏度高等特定，是目前分子标记辅助育种工作中极具发展前景的分子标记。

西瓜叶片黄化性状是目前发现的苗期鉴定西瓜杂交种子纯度最理想的标记性状。西瓜叶片黄化性状植株叶片全生育期均为黄化叶片，而正常绿植株叶片全生育期均为绿色。因此，黄化与一般正常绿幼苗或植株有明显的区别，最早鉴别期在子叶出土到幼苗1片真叶期间，时间在播种后7-10d。通过鉴定黄化基因，开发其紧密连锁的分子标记进行品种初期筛选，达到分子辅助育种的目的，可大大缩短育种的周期，提高育种效率。

西瓜叶片黄化性状在苗期即能准确鉴定杂种，具有准确、直观、简便、快速、低耗等优点。但该性状是隐性的，杂交一代不表现，给选育工作带来了很大难度。叶色是西瓜重要的农艺性状，与西瓜植株的光合作用能力息息相关，因此急需深入开展西瓜叶色研究，开发可用于西瓜育种的分子标记，以缩短育种进程提高育种效率。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记及其应用，可以用来对西瓜品种进行初期筛选，检测方法确可靠，能够大大缩短育种周期。

为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

本发明提供一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记，所述InDel分子标记的连锁基因位点开始于西瓜参考基因组97103V2版本的第2号染色体第16217471bp位碱基处，所述InDel分子标记的扩增长度为122bp和/或142bp，若扩增基因片段长度为122bp则为西瓜叶片黄化纯合单株，若扩增基因片段长度为142bp则为西瓜叶片正常绿纯合单株，若扩增基因片段长度为122bp和142bp则为西瓜叶片正常绿杂合单株。

本发明还提供扩增与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记的引物对，所述引物对的正向引物序列如SEQ ID NO.3所示、反向引物序列如SEQ ID NO.4所示。