[发明专利]与湖羊生长性状相关的分子标记、其检测方法及应用

说明书

本发明提供了一种与湖羊生长性状相关的分子标记、其检测方法及应用。本发明通过对湖羊AHSG基因进行PCR扩增和序列分析，发现在扩增片段的第234位存在一个T/C多态性位点，进一步使用KASPar引物对1481只湖羊的多态性位点进行检测和建立最小二乘模型，对基因型与生长性状进行关联分析，最终确定了本发明扩增的AHSG基因片段可以作为与湖羊平均日增重和饲料转化率相关的分子标记。本发明通过检测分子标记，可用于选留基因为CC纯合型湖羊进入核心群作为种羊，以改善湖羊的生长性状，有助于增加经济效益。

技术领域

本发明属于分子标记的技术领域，具体涉及AHSG基因片段作为影响湖羊生长性状的分子标记、其检测方法及应用。

背景技术

湖羊α2-HS糖蛋白基因(AHSG)位于1号染色体上，属于3型半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族蛋白，AHSG是胰岛素刺激的IR-TK的天然抑制剂(Auberger et al.，1989；Srinivas etal.，1993)。AHSG基因参与动物体脂和胰岛素敏感性的调节，被认为是影响体脂含量和代谢的候选基因(LavebrattC.，2005)。而在人类中，AHSG是一种主要在肝脏合成的血浆蛋白(Yang，Chen，Bergeron，Cupples，Friedrichs，1992)。此外，有报道称AHSG基因的Ser单倍型与男性的瘦弱有关(C.Lavebratt，Wahlqvist，Nor Df Ors，Hoffstedt，Arner，2005)。Lavebratt等人(LavebrattC.,2005)研究表明，AHSG基因多态性与皮下脂肪细胞的脂解有关。敲除AHSG基因的小鼠体内脂肪含量较低，并且对体重增加有抵抗力，这表明AHSG在肥胖的发展中起着重要作用(Mathews et al.，2002)。然而，截至目前，AHSG基因在湖羊上的研究较少，具体对湖羊的作用也不清楚。

发明内容

为了克服现有技术的缺陷，本发明提供一种作为与湖羊生长性状相关的分子标记、其检测方法及应用。本发明的分子标记是从湖羊AHSG基因中扩增得到，其具体核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。通过扩增湖羊AHSG基因的DNA序列并测序，寻找AHSG基因的多态性位点，分析不同的基因型与湖羊生长性状相关性，并建立含多态性位点的分子标记的检测方法，并可将该分子标记应用于新型优质肉羊新品种的培育中。

为实现上述目的，本发明采用以下的技术方案为：

一种与湖羊生长性状相关的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中第234bp位的Y表示T或C，由于上述序列在第234位碱基处有一个T/C突变，从而导致了湖羊AHSG基因在该位点的T/C多态性。

一种检测上述分子标记的引物对，优选地，其包括正向引物F和反向引物R，所述正向引物F和反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示序列。

一种检测上述分子标记的KASPar引物对，其包括正向引物1、正向引物2和反向引物C，所述正向引物1的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示，所述正向引物2如SEQ ID NO.5所示，所述反向引物C如SEQ ID NO.6所示。

一种检测上述分子标记的试剂盒，所述试剂盒中包含了检测上述分子标记的PCR引物对或KASPar引物对。

一种检测与湖羊生长性状相关的分子标记的方法，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中第234bp位的Y表示T或C，所述方法包括利用上述的引物对或试剂盒对湖羊的基因组DNA进行检测，具体检测方法包括如下步骤：

a)使用上述的引物对、KASPar引物对或包含上述引物对的试剂盒，对湖羊基因组DNA进行扩增；

b)对步骤a)获得的扩增产物的多态性位点进行鉴定。

其中，在步骤b)中，上述分型鉴定的方法包括但不限于直接测序法、探针法、基因芯片法、高分辨率溶解曲线法。