[发明专利]一种利用SSR标记鉴定红姜花与白姜花种间杂交F1 在审
申请号: | 202210681115.6 | 申请日: | 2022-06-16 |
公开(公告)号: | CN115044656A | 公开(公告)日: | 2022-09-13 |
发明(设计)人: | 范燕萍;魏雪;周熠玮;玉云祎;余让才 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 赵崇杨 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 ssr 标记 鉴定 红姜花 花种 间杂 base sub | ||
1.一种利用SSR标记鉴定红姜花与白姜花种间杂交F1杂种真实性的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1.分别提取亲本红姜花、白姜花及其种间杂交F1代杂种的基因组DNA;
S2.SSR毛细管电泳分析:分别以步骤S1提取的基因组DNA为模板,采用SSR标记引物HcgSSR115和/或HcgSSR1951进行SSR-PCR扩增检测,采集扩增产物的特征峰;所述HcgSSR115的引物序列如SEQ ID NO.1~2所示,HcgSSR1951的引物序列如SEQ ID NO.3~4所示;
S3.杂种真实性的鉴定:将步骤S2中种间杂交F1代杂种的特征峰与亲本的特征峰进行比对,若同时具有亲本特征峰则为真实杂交种。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤S1中提取亲本和其种间杂交F1代杂种的幼嫩叶片。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,在步骤S1中对提取的基因组DNA进行1%的琼脂糖凝胶电泳,检测DNA纯度。
4.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述标记引物的上游引物5’尾端接有FAM荧光标记。
5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤S2中SSR-PCR扩增的体系(25μL):50ng·μL-1模板DNA 1.0μL,10μM dNTP(mix)0.5μL,10×Taq Buffer(with MgCl2)2.5μL,10mM上游引物和下游引物各1μL,5U·μL Taq酶0.2μL,超纯水19.8μL。
6.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤S2中SSR-PCR扩增反应程序:95℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环;72℃修复延伸10min。
7.SEQ ID NO.1~4所示的SSR标记引物HcgSSR115和/或HcgSSR1951在鉴定红姜花与白姜花种间杂交F1杂种真实性中的应用。
8.一种鉴定红姜花与白姜花种间杂交F1杂种真实性的试剂盒,其特征在于,含有SSR标记引物HcgSSR115和/或HcgSSR1951,所述引物序列依次如SEQ ID NO.1~4所示。
9.根据权利要求8所述试剂盒,其特征在于,还包含SSR-PCR扩增所需试剂。
10.根据权利要求8所述试剂盒,其特征在于,还包含提取样本DNA所需的试剂。
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