[发明专利]龟甲牡丹PEPC基因序列及其在基于KASP的龟甲牡丹鉴别中的应用在审
| 申请号： | 202210689687.9 | 申请日： | 2022-06-17 |
| 公开（公告）号： | CN114958873A | 公开（公告）日： | 2022-08-30 |
| 发明（设计）人： | 李井干;吴晶;余本渊;许忠祥;伏见国;杨晓军;李洋;郭静;刘晓宇;杨静 | 申请（专利权）人： | 南京海关动植物与食品检测中心 |
| 主分类号： | C12N15/29 | 分类号： | C12N15/29;C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 北京太兆天元知识产权代理有限责任公司 11108 | 代理人： | 张洪年 |
| 地址： | 210019 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 龟甲 牡丹 pepc 基因 序列 及其 基于 kasp 鉴别 中的 应用 | ||
1.龟甲牡丹PEPC基因序列，其特征在于：所述PEPC基因序列如SEQ ID NO:1所示。
2.权利要求1所述的龟甲牡丹PEPC基因序列在鉴别或辅助鉴别龟甲牡丹中的应用。
3.一种检测龟甲牡丹中PEPC基因序列中的SNP位点的物质在鉴别或辅助鉴别龟甲牡丹中的应用，其特征在于，所述SNP位点为PEPC基因序列中第152号核酸位点，其碱基为G。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述物质为如SEQ ID NO:2所示的正向引物PCC-A-fis-f1-1、如SEQ ID NO:3所示的正向引物PCC-A-fis-f1-2以及如SEQ ID NO:4所述的反向引物PCC-A-fis-r1组成的引物组合。
5.一种试剂盒，所述试剂盒包含如SEQ ID NO:2所示的正向引物PCC-A-fis-f1-1、如SEQ ID NO:3所示的正向引物PCC-A-fis-f1-2以及如SEQ ID NO:4所述的反向引物PCC-A-fis-r1。
6.权利要求5所述的试剂盒在鉴别或辅助鉴别黑牡丹中的应用。
7.一种鉴别或辅助鉴别龟甲牡丹的方法，包括如下步骤：对待检测样品基因DNA进行PCR扩增，得到待检测PCR扩增产物；然后对PCR扩增产物进行KASP反应，并根据基因分型结果，确定其是否为龟甲牡丹。
8.根据权利要求7所述的鉴别或辅助鉴别龟甲牡丹的方法，其特征在于：所述PCR扩增采用核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的正向引物PCC-A-fis-f1-1、如SEQ ID NO:3所示的正向引物PCC-A-fis-f1-2以及如SEQ ID NO:4所述的反向引物PCC-A-fis-r1组成的引物组合。
9.根据权利要求7所述的鉴别或辅助鉴别黑牡丹的方法，其特征在于：所述如SEQ IDNO:2所示的正向引物PCC-A-fis-f1-1的5′端加上GAAGGTGACCAAGTTCATGCT接头序列、如SEQID NO:3所示的正向引物PCC-A-fis-f1-2的5’端加上GAAGGTCGGAGTCAACGGATT接头序列。
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